Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRNQ16849 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms