Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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TMED1Q13445 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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TMED1Q13445 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMED1Q13445 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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