Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNTA1Q13424 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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