Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
BNIP1Q12981 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms