Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB25P57735 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB25P57735 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB25P57735 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB25P57735 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB25P57735 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB25P57735 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB25P57735 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB25P57735 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB25P57735 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB25P57735 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB25P57735 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB25P57735 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB25P57735 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB25P57735 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB25P57735 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB25P57735 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB25P57735 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB25P57735 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB25P57735 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB25P57735 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB25P57735 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB25P57735 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB25P57735 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB25P57735 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB25P57735 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB25P57735 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB25P57735 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB25P57735 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB25P57735 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB25P57735 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB25P57735 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB25P57735 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB25P57735 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB25P57735 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB25P57735 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB25P57735 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB25P57735 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB25P57735 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB25P57735 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB25P57735 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB25P57735 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB25P57735 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB25P57735 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB25P57735 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB25P57735 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB25P57735 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB25P57735 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB25P57735 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB25P57735 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB25P57735 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB25P57735 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB25P57735 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB25P57735 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB25P57735 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB25P57735 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB25P57735 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB25P57735 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB25P57735 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB25P57735 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB25P57735 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB25P57735 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB25P57735 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB25P57735 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB25P57735 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB25P57735 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB25P57735 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB25P57735 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB25P57735 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB25P57735 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB25P57735 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB25P57735 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB25P57735 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB25P57735 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB25P57735 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB25P57735 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB25P57735 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB25P57735 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB25P57735 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB25P57735 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB25P57735 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB25P57735 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB25P57735 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB25P57735 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB25P57735 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB25P57735 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB25P57735 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB25P57735 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB25P57735 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB25P57735 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB25P57735 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB25P57735 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB25P57735 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB25P57735 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB25P57735 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB25P57735 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB25P57735 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB25P57735 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB25P57735 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB25P57735 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms