Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2E1P51965 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UBE2E1P51965 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms