Protein–RNA interactions for Protein: P26599

PTBP1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP1P26599 SMOC1-202ENST00000381280 3666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.691e-8■■■■■ 34.5
PTBP1P26599 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.762e-6■■■■■ 34.5
PTBP1P26599 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 34.5
PTBP1P26599 RHOT1-209ENST00000581031 3013 ntTSL 1 (best)16.58■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 34.5
PTBP1P26599 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 34.5
PTBP1P26599 RHOT1-215ENST00000583994 3289 ntTSL 215.51■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 34.5
PTBP1P26599 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 34.5
PTBP1P26599 RHOT1-210ENST00000581094 3231 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.912e-6■■■■■ 34.5
PTBP1P26599 RHOT1-208ENST00000580976 567 ntTSL 43.89□□□□□ -1.792e-6■■■■■ 34.5
PTBP1P26599 RHOT1-206ENST00000578205 2771 ntTSL 1 (best)3.2□□□□□ -1.92e-6■■■■■ 34.5
PTBP1P26599 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.982e-6■■■■■ 34.5
PTBP1P26599 XRCC5-202ENST00000392133 3761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.156e-7■■■■■ 34.4
PTBP1P26599 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.436e-7■■■■■ 34.4
PTBP1P26599 SPIRE1-207ENST00000462226 536 ntTSL 46.77□□□□□ -1.339e-7■■■■■ 34.4
PTBP1P26599 SPIRE1-205ENST00000449797 701 ntTSL 35.15□□□□□ -1.599e-7■■■■■ 34.4
PTBP1P26599 SPIRE1-210ENST00000497844 546 ntTSL 55.15□□□□□ -1.599e-7■■■■■ 34.4
PTBP1P26599 ZNF516-205ENST00000617840 2326 ntTSL 1 (best)16.89■□□□□ 0.292e-8■■■■■ 34.4
PTBP1P26599 ZNF516-203ENST00000542818 346 ntTSL 28.13□□□□□ -1.112e-8■■■■■ 34.4
PTBP1P26599 PRSS16-220ENST00000495683 914 ntTSL 313.37□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 34.4
PTBP1P26599 PRSS16-204ENST00000454665 1464 ntTSL 213.21□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 34.4
PTBP1P26599 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.484e-7■■■■■ 34.4
PTBP1P26599 AL390879.2-202ENST00000431464 646 ntTSL 213.59□□□□□ -0.234e-7■■■■■ 34.4
PTBP1P26599 AC093752.1-213ENST00000503038 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.265e-9■■■■■ 34.3
PTBP1P26599 KIAA0368-203ENST00000374383 573 ntAPPRIS ALT2 TSL 27.81□□□□□ -1.162e-11■■■■■ 34.3
PTBP1P26599 KIAA0368-204ENST00000465499 1189 ntTSL 25.65□□□□□ -1.52e-11■■■■■ 34.3
PTBP1P26599 CPED1-209ENST00000520801 553 ntTSL 48.55□□□□□ -1.047e-7■■■■■ 34.3
PTBP1P26599 GARNL3-201ENST00000373386 3143 ntTSL 28.07□□□□□ -1.123e-6■■■■■ 34.3
PTBP1P26599 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.283e-6■■■■■ 34.3
PTBP1P26599 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.283e-6■■■■■ 34.3
PTBP1P26599 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.231e-9■■■■■ 34.3
PTBP1P26599 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.281e-9■■■■■ 34.3
PTBP1P26599 HSD17B2-201ENST00000199936 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.283e-8■■■■■ 34.3
PTBP1P26599 HSD17B2-205ENST00000568090 865 ntTSL 36.62□□□□□ -1.353e-8■■■■■ 34.3
PTBP1P26599 HSD17B2-204ENST00000566838 7925 ntTSL 26.4□□□□□ -1.383e-8■■■■■ 34.3
PTBP1P26599 ARVCF-206ENST00000467828 258 ntTSL 314.51□□□□□ -0.098e-9■■■■■ 34.3
PTBP1P26599 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.218e-9■■■■■ 34.3
PTBP1P26599 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 34.3
PTBP1P26599 NCOA7-210ENST00000453302 581 ntTSL 39.59□□□□□ -0.871e-7■■■■■ 34.3
PTBP1P26599 NCOA7-204ENST00000417494 765 ntTSL 28.33□□□□□ -1.081e-7■■■■■ 34.3
PTBP1P26599 NCOA7-206ENST00000428318 548 ntTSL 37.52□□□□□ -1.211e-7■■■■■ 34.3
PTBP1P26599 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.491e-7■■■■■ 34.3
PTBP1P26599 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.691e-7■■■■■ 34.3
PTBP1P26599 NCOA7-205ENST00000419660 488 ntTSL 54.36□□□□□ -1.711e-7■■■■■ 34.3
PTBP1P26599 NCOA7-211ENST00000487635 758 ntTSL 1 (best)3.78□□□□□ -1.81e-7■■■■■ 34.3
PTBP1P26599 SUPT3H-205ENST00000475057 1377 ntTSL 27.14□□□□□ -1.273e-7■■■■■ 34.3
PTBP1P26599 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.593e-7■■■■■ 34.3
PTBP1P26599 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.683e-7■■■■■ 34.3
PTBP1P26599 MALRD1-205ENST00000480707 414 ntTSL 32.89□□□□□ -1.954e-7■■■■■ 34.3
PTBP1P26599 IFFO1-203ENST00000396830 1776 ntTSL 1 (best)16.2■□□□□ 0.186e-11■■■■■ 34.2
PTBP1P26599 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 34.2
PTBP1P26599 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 34.2
PTBP1P26599 RAB2A-205ENST00000466595 866 ntTSL 39.73□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 34.2
PTBP1P26599 RAB2A-208ENST00000529579 680 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.261e-6■■■■■ 34.2
PTBP1P26599 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.673e-7■■■■■ 34.2
PTBP1P26599 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.113e-7■■■■■ 34.2
PTBP1P26599 EEFSEC-204ENST00000484438 640 ntTSL 311.96□□□□□ -0.493e-7■■■■■ 34.2
PTBP1P26599 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 34.2
PTBP1P26599 SCD-201ENST00000370355 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.061e-9■■■■■ 34.2
PTBP1P26599 VPS37A-203ENST00000518038 655 ntTSL 313.47□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 34.2
PTBP1P26599 VPS37A-204ENST00000519381 575 ntTSL 411.86□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 34.2
PTBP1P26599 DNAJC6-202ENST00000371069 5365 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 34.2
PTBP1P26599 TAF1-201ENST00000276072 5692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.196e-7■■■■■ 34.2
PTBP1P26599 TAF1-204ENST00000423759 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.236e-7■■■■■ 34.2
PTBP1P26599 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.36e-7■■■■■ 34.2
PTBP1P26599 CENPI-203ENST00000403304 622 ntTSL 39.73□□□□□ -0.851e-9■■■■■ 34.2
PTBP1P26599 CENPI-205ENST00000435570 390 ntTSL 32.78□□□□□ -1.961e-9■■■■■ 34.2
PTBP1P26599 APTX-232ENST00000495360 1313 ntTSL 513.04□□□□□ -0.323e-8■■■■■ 34.1
PTBP1P26599 APTX-210ENST00000460945 542 ntTSL 412.47□□□□□ -0.413e-8■■■■■ 34.1
PTBP1P26599 APTX-231ENST00000494973 547 ntTSL 411.37□□□□□ -0.593e-8■■■■■ 34.1
PTBP1P26599 APTX-202ENST00000379812 599 ntTSL 511.37□□□□□ -0.593e-8■■■■■ 34.1
PTBP1P26599 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.623e-8■■■■■ 34.1
PTBP1P26599 APTX-203ENST00000379813 1121 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.683e-8■■■■■ 34.1
PTBP1P26599 APTX-208ENST00000436040 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.73e-8■■■■■ 34.1
PTBP1P26599 APTX-201ENST00000309615 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.753e-8■■■■■ 34.1
PTBP1P26599 APTX-221ENST00000477119 568 ntTSL 310.07□□□□□ -0.83e-8■■■■■ 34.1
PTBP1P26599 APTX-207ENST00000397172 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.873e-8■■■■■ 34.1
PTBP1P26599 APTX-220ENST00000476858 1068 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.883e-8■■■■■ 34.1
PTBP1P26599 APTX-206ENST00000379825 2023 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.893e-8■■■■■ 34.1
PTBP1P26599 APTX-224ENST00000480031 674 ntTSL 58.82□□□□□ -13e-8■■■■■ 34.1
PTBP1P26599 APTX-212ENST00000464632 679 ntTSL 1 (best)8.81□□□□□ -13e-8■■■■■ 34.1
PTBP1P26599 APTX-217ENST00000473221 687 ntTSL 28.81□□□□□ -13e-8■■■■■ 34.1
PTBP1P26599 APTX-205ENST00000379819 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -13e-8■■■■■ 34.1
PTBP1P26599 APTX-230ENST00000494649 2099 ntTSL 1 (best)8.73□□□□□ -1.013e-8■■■■■ 34.1
PTBP1P26599 APTX-222ENST00000478279 684 ntTSL 1 (best)7.71□□□□□ -1.183e-8■■■■■ 34.1
PTBP1P26599 APTX-219ENST00000474658 952 ntTSL 57.45□□□□□ -1.223e-8■■■■■ 34.1
PTBP1P26599 CD99-208ENST00000482405 842 ntTSL 216.11■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 34.1
PTBP1P26599 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 34.1
PTBP1P26599 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.565e-8■■■■■ 34.1
PTBP1P26599 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.424e-6■■■■■ 34.1
PTBP1P26599 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.371e-7■■■■■ 34.1
PTBP1P26599 RAI14-215ENST00000510319 557 ntTSL 414.82□□□□□ -0.044e-6■■■■■ 34.1
PTBP1P26599 RAI14-224ENST00000514527 660 ntTSL 314.6□□□□□ -0.074e-6■■■■■ 34.1
PTBP1P26599 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.174e-6■■■■■ 34.1
PTBP1P26599 RAI14-225ENST00000514873 542 ntTSL 412.48□□□□□ -0.414e-6■■■■■ 34.1
PTBP1P26599 RAI14-203ENST00000502736 569 ntTSL 49.68□□□□□ -0.864e-6■■■■■ 34.1
PTBP1P26599 RAI14-222ENST00000513974 548 ntTSL 49.68□□□□□ -0.864e-6■■■■■ 34.1
PTBP1P26599 RAI14-226ENST00000514931 550 ntTSL 28.8□□□□□ -14e-6■■■■■ 34.1
PTBP1P26599 RAI14-220ENST00000512629 2941 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.144e-6■■■■■ 34.1
PTBP1P26599 RAI14-213ENST00000508777 1387 ntTSL 1 (best)7.32□□□□□ -1.244e-6■■■■■ 34.1
PTBP1P26599 RAI14-205ENST00000503673 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.254e-6■■■■■ 34.1
Retrieved 100 of 27,725 protein–RNA pairs in 387.5 ms