Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA2P17301 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA2P17301 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA2P17301 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA2P17301 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA2P17301 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA2P17301 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA2P17301 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA2P17301 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA2P17301 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA2P17301 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA2P17301 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA2P17301 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA2P17301 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA2P17301 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA2P17301 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA2P17301 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA2P17301 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA2P17301 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA2P17301 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA2P17301 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA2P17301 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA2P17301 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA2P17301 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA2P17301 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA2P17301 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA2P17301 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ITGA2P17301 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGA2P17301 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms