Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UFL1O94874 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UFL1O94874 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UFL1O94874 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UFL1O94874 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UFL1O94874 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UFL1O94874 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UFL1O94874 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UFL1O94874 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UFL1O94874 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UFL1O94874 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UFL1O94874 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UFL1O94874 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UFL1O94874 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UFL1O94874 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UFL1O94874 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UFL1O94874 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UFL1O94874 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UFL1O94874 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UFL1O94874 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UFL1O94874 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UFL1O94874 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
UFL1O94874 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
UFL1O94874 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UFL1O94874 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UFL1O94874 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UFL1O94874 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UFL1O94874 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UFL1O94874 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UFL1O94874 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UFL1O94874 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UFL1O94874 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
UFL1O94874 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UFL1O94874 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UFL1O94874 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UFL1O94874 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UFL1O94874 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UFL1O94874 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UFL1O94874 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UFL1O94874 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UFL1O94874 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UFL1O94874 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UFL1O94874 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UFL1O94874 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UFL1O94874 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UFL1O94874 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UFL1O94874 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UFL1O94874 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UFL1O94874 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UFL1O94874 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UFL1O94874 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UFL1O94874 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UFL1O94874 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UFL1O94874 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UFL1O94874 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UFL1O94874 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UFL1O94874 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UFL1O94874 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UFL1O94874 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UFL1O94874 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UFL1O94874 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UFL1O94874 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UFL1O94874 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UFL1O94874 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UFL1O94874 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UFL1O94874 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UFL1O94874 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UFL1O94874 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UFL1O94874 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UFL1O94874 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UFL1O94874 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UFL1O94874 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UFL1O94874 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UFL1O94874 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UFL1O94874 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UFL1O94874 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UFL1O94874 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UFL1O94874 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UFL1O94874 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UFL1O94874 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UFL1O94874 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UFL1O94874 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UFL1O94874 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UFL1O94874 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UFL1O94874 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UFL1O94874 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UFL1O94874 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UFL1O94874 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UFL1O94874 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UFL1O94874 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UFL1O94874 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UFL1O94874 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UFL1O94874 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UFL1O94874 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UFL1O94874 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UFL1O94874 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UFL1O94874 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UFL1O94874 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UFL1O94874 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UFL1O94874 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms