Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATCO43716 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATCO43716 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATCO43716 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATCO43716 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATCO43716 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATCO43716 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATCO43716 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATCO43716 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATCO43716 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATCO43716 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATCO43716 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATCO43716 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATCO43716 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATCO43716 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATCO43716 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATCO43716 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATCO43716 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GATCO43716 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATCO43716 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATCO43716 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATCO43716 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATCO43716 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATCO43716 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATCO43716 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATCO43716 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATCO43716 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATCO43716 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATCO43716 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATCO43716 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATCO43716 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATCO43716 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATCO43716 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATCO43716 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATCO43716 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATCO43716 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATCO43716 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATCO43716 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATCO43716 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATCO43716 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATCO43716 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATCO43716 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GATCO43716 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATCO43716 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATCO43716 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATCO43716 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GATCO43716 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATCO43716 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATCO43716 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATCO43716 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATCO43716 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATCO43716 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATCO43716 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATCO43716 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATCO43716 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATCO43716 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATCO43716 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATCO43716 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATCO43716 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATCO43716 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATCO43716 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATCO43716 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATCO43716 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATCO43716 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATCO43716 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATCO43716 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATCO43716 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATCO43716 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATCO43716 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATCO43716 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GATCO43716 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATCO43716 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATCO43716 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATCO43716 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATCO43716 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATCO43716 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATCO43716 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATCO43716 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATCO43716 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATCO43716 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATCO43716 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATCO43716 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATCO43716 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATCO43716 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATCO43716 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATCO43716 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATCO43716 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATCO43716 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATCO43716 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATCO43716 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATCO43716 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATCO43716 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATCO43716 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATCO43716 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATCO43716 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATCO43716 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATCO43716 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATCO43716 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATCO43716 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GATCO43716 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms