Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF879B4DU55 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF879B4DU55 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms