Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PALM2-AKAP2B1ALY0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PALM2-AKAP2B1ALY0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALM2-AKAP2B1ALY0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms