Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC66A2RUB6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC66A2RUB6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms