Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y639

NPTN, Neuroplastin, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTNQ9Y639 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPTNQ9Y639 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPTNQ9Y639 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPTNQ9Y639 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPTNQ9Y639 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPTNQ9Y639 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPTNQ9Y639 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPTNQ9Y639 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPTNQ9Y639 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPTNQ9Y639 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NPTNQ9Y639 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPTNQ9Y639 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPTNQ9Y639 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPTNQ9Y639 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPTNQ9Y639 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NPTNQ9Y639 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NPTNQ9Y639 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPTNQ9Y639 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPTNQ9Y639 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPTNQ9Y639 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPTNQ9Y639 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPTNQ9Y639 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPTNQ9Y639 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPTNQ9Y639 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPTNQ9Y639 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPTNQ9Y639 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPTNQ9Y639 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPTNQ9Y639 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPTNQ9Y639 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPTNQ9Y639 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPTNQ9Y639 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPTNQ9Y639 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPTNQ9Y639 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPTNQ9Y639 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NPTNQ9Y639 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPTNQ9Y639 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPTNQ9Y639 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPTNQ9Y639 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPTNQ9Y639 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPTNQ9Y639 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPTNQ9Y639 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPTNQ9Y639 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NPTNQ9Y639 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPTNQ9Y639 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPTNQ9Y639 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPTNQ9Y639 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPTNQ9Y639 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NPTNQ9Y639 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPTNQ9Y639 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NPTNQ9Y639 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPTNQ9Y639 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPTNQ9Y639 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPTNQ9Y639 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPTNQ9Y639 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPTNQ9Y639 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPTNQ9Y639 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NPTNQ9Y639 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NPTNQ9Y639 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPTNQ9Y639 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPTNQ9Y639 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPTNQ9Y639 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPTNQ9Y639 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPTNQ9Y639 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPTNQ9Y639 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPTNQ9Y639 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPTNQ9Y639 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPTNQ9Y639 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPTNQ9Y639 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPTNQ9Y639 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPTNQ9Y639 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPTNQ9Y639 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPTNQ9Y639 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPTNQ9Y639 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPTNQ9Y639 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPTNQ9Y639 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPTNQ9Y639 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPTNQ9Y639 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPTNQ9Y639 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPTNQ9Y639 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPTNQ9Y639 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPTNQ9Y639 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPTNQ9Y639 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPTNQ9Y639 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NPTNQ9Y639 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPTNQ9Y639 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPTNQ9Y639 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPTNQ9Y639 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPTNQ9Y639 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPTNQ9Y639 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPTNQ9Y639 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPTNQ9Y639 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPTNQ9Y639 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPTNQ9Y639 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPTNQ9Y639 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPTNQ9Y639 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPTNQ9Y639 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPTNQ9Y639 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPTNQ9Y639 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPTNQ9Y639 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NPTNQ9Y639 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms