Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J1

UTP18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP18Q9Y5J1 SLCO4A1-208ENST00000497209 3092 ntTSL 1 (best)16.3■□□□□ 0.25e-6■■■■□ 22
UTP18Q9Y5J1 DAZAP1-209ENST00000590419 508 ntTSL 315.3■□□□□ 0.044e-6■■■■□ 22
UTP18Q9Y5J1 C15orf39-206ENST00000565074 3152 ntAPPRIS ALT215.14■□□□□ 0.015e-6■■■■□ 22
UTP18Q9Y5J1 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.015e-6■■■■□ 22
UTP18Q9Y5J1 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.065e-6■■■■□ 22
UTP18Q9Y5J1 C15orf39-201ENST00000360639 4517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.345e-6■■■■□ 22
UTP18Q9Y5J1 RALGAPA2-206ENST00000620717 1432 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.425e-6■■■■□ 22
UTP18Q9Y5J1 RALGAPA2-203ENST00000427175 2623 ntTSL 210.07□□□□□ -0.85e-6■■■■□ 22
UTP18Q9Y5J1 RALGAPA2-204ENST00000430436 8769 ntTSL 59.44□□□□□ -0.95e-6■■■■□ 22
UTP18Q9Y5J1 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.325e-6■■■■□ 22
UTP18Q9Y5J1 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.095e-7■■■■□ 21.9
UTP18Q9Y5J1 C22orf34-205ENST00000416411 542 ntTSL 414.91□□□□□ -0.025e-7■■■■□ 21.9
UTP18Q9Y5J1 GUK1-231ENST00000485859 325 ntTSL 1 (best)18.82■□□□□ 0.62e-6■■■■□ 21.8
UTP18Q9Y5J1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.492e-6■■■■□ 21.8
UTP18Q9Y5J1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.492e-6■■■■□ 21.8
UTP18Q9Y5J1 GUK1-228ENST00000485168 737 ntTSL 316.93■□□□□ 0.32e-6■■■■□ 21.8
UTP18Q9Y5J1 GUK1-219ENST00000470040 2548 ntTSL 216.65■□□□□ 0.262e-6■■■■□ 21.8
UTP18Q9Y5J1 GUK1-237ENST00000495999 555 ntTSL 316.49■□□□□ 0.232e-6■■■■□ 21.8
UTP18Q9Y5J1 GUK1-214ENST00000460224 639 ntTSL 516.42■□□□□ 0.222e-6■■■■□ 21.8
UTP18Q9Y5J1 GUK1-216ENST00000464858 633 ntTSL 316.29■□□□□ 0.22e-6■■■■□ 21.8
UTP18Q9Y5J1 GUK1-211ENST00000412265 1012 ntTSL 514.52□□□□□ -0.092e-6■■■■□ 21.8
UTP18Q9Y5J1 GUK1-223ENST00000478725 414 ntTSL 314.38□□□□□ -0.112e-6■■■■□ 21.8
UTP18Q9Y5J1 GUK1-229ENST00000485733 345 ntTSL 314.06□□□□□ -0.162e-6■■■■□ 21.8
UTP18Q9Y5J1 GUK1-221ENST00000472939 314 ntTSL 313.75□□□□□ -0.212e-6■■■■□ 21.8
UTP18Q9Y5J1 GUK1-232ENST00000486668 738 ntTSL 313.68□□□□□ -0.222e-6■■■■□ 21.8
UTP18Q9Y5J1 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.186e-12■■■■□ 21.5
UTP18Q9Y5J1 EIF1AX-202ENST00000379607 4427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.666e-12■■■■□ 21.5
UTP18Q9Y5J1 UBR4-206ENST00000419533 5583 ntTSL 59.39□□□□□ -0.918e-11■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 AGRN-205ENST00000469403 899 ntTSL 328.59■■■□□ 2.173e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.733e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 AGRN-206ENST00000477585 707 ntTSL 325.76■■□□□ 1.713e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 SCRIB-207ENST00000531942 421 ntTSL 222.65■■□□□ 1.223e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.063e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.853e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.853e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.643e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.643e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 DVL1-203ENST00000472445 639 ntTSL 218.93■□□□□ 0.623e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 MED24-225ENST00000580885 1963 ntTSL 518.59■□□□□ 0.573e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.553e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.553e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.513e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.453e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 MED24-213ENST00000535071 2441 ntTSL 517.05■□□□□ 0.323e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 KDM4B-206ENST00000588361 3039 ntTSL 216.88■□□□□ 0.293e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.293e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.223e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.123e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.13e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 KDM4B-208ENST00000589104 3470 ntTSL 214.63□□□□□ -0.073e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 MED24-214ENST00000535508 3334 ntTSL 213.87□□□□□ -0.193e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.233e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 MED24-212ENST00000501516 3037 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.283e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 MED24-201ENST00000356271 3446 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.343e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 MED24-203ENST00000394127 3456 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.383e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 MED24-202ENST00000394126 3896 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.543e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 MED24-231ENST00000584782 542 ntTSL 39.97□□□□□ -0.813e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 KDM4B-207ENST00000588961 560 ntTSL 49.49□□□□□ -0.893e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 MED24-228ENST00000581058 524 ntTSL 48.91□□□□□ -0.983e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 MED24-219ENST00000578901 728 ntTSL 1 (best)8.31□□□□□ -1.083e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 MED24-234ENST00000614384 454 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.133e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.223e-6■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.172e-8■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 PID1-206ENST00000534952 553 ntTSL 414.53□□□□□ -0.082e-8■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.162e-8■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.182e-8■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 PID1-201ENST00000354069 839 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.022e-8■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 PID1-205ENST00000482518 479 ntTSL 26.57□□□□□ -1.362e-8■■■■□ 21.4
UTP18Q9Y5J1 MYH9-201ENST00000216181 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.43e-6■■■■□ 21.3
UTP18Q9Y5J1 CBFA2T3-207ENST00000564416 399 ntTSL 516.08■□□□□ 0.162e-6■■■■□ 20.9
UTP18Q9Y5J1 CBFA2T3-209ENST00000569443 469 ntTSL 513.84□□□□□ -0.192e-6■■■■□ 20.9
UTP18Q9Y5J1 CBFA2T3-211ENST00000570046 284 ntTSL 310.38□□□□□ -0.752e-6■■■■□ 20.9
UTP18Q9Y5J1 LAMA5-202ENST00000370677 1674 ntTSL 221.72■■□□□ 1.076e-6■■■■□ 20.7
UTP18Q9Y5J1 MICALL2-208ENST00000472100 5248 ntTSL 219.79■□□□□ 0.762e-6■■■■□ 20.7
UTP18Q9Y5J1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.482e-6■■■■□ 20.7
UTP18Q9Y5J1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.598e-55■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 NCAPD2-207ENST00000539084 4290 ntTSL 212.08□□□□□ -0.478e-55■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 NCAPD2-202ENST00000382457 2844 ntTSL 511.75□□□□□ -0.538e-55■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 NCAPD2-208ENST00000539714 533 ntTSL 37.58□□□□□ -1.28e-55■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 NCAPD2-210ENST00000541399 584 ntTSL 57.22□□□□□ -1.258e-55■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.08□□□□□ -1.68e-55■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.69□□□□□ -1.668e-55■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.131e-14■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-222ENST00000451607 1007 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.451e-14■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-224ENST00000454068 688 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.71e-14■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-216ENST00000443799 897 ntTSL 510□□□□□ -0.811e-14■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-214ENST00000436656 822 ntTSL 310□□□□□ -0.811e-14■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-210ENST00000431268 1698 ntTSL 29.37□□□□□ -0.911e-14■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-219ENST00000449289 542 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.021e-14■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-220ENST00000449589 712 ntTSL 38.69□□□□□ -1.021e-14■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-226ENST00000455838 632 ntTSL 28.69□□□□□ -1.021e-14■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-203ENST00000416952 799 ntTSL 28.18□□□□□ -1.11e-14■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.161e-14■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-227ENST00000456293 583 ntTSL 37.67□□□□□ -1.181e-14■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-228ENST00000456812 723 ntTSL 37.32□□□□□ -1.241e-14■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-206ENST00000422183 745 ntTSL 26.69□□□□□ -1.341e-14■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.411e-14■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-201ENST00000412059 979 ntTSL 55.83□□□□□ -1.481e-14■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-205ENST00000422008 497 ntTSL 35.25□□□□□ -1.571e-14■■■■□ 20.4
UTP18Q9Y5J1 GAS5-215ENST00000442067 1114 ntTSL 25.06□□□□□ -1.61e-14■■■■□ 20.4
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