Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2R0

COA3, Cytochrome c oxidase assembly factor 3 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA3Q9Y2R0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COA3Q9Y2R0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COA3Q9Y2R0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COA3Q9Y2R0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COA3Q9Y2R0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COA3Q9Y2R0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COA3Q9Y2R0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COA3Q9Y2R0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COA3Q9Y2R0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COA3Q9Y2R0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COA3Q9Y2R0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COA3Q9Y2R0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COA3Q9Y2R0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COA3Q9Y2R0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COA3Q9Y2R0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COA3Q9Y2R0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COA3Q9Y2R0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COA3Q9Y2R0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COA3Q9Y2R0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COA3Q9Y2R0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COA3Q9Y2R0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COA3Q9Y2R0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COA3Q9Y2R0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COA3Q9Y2R0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COA3Q9Y2R0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COA3Q9Y2R0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COA3Q9Y2R0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COA3Q9Y2R0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COA3Q9Y2R0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COA3Q9Y2R0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COA3Q9Y2R0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COA3Q9Y2R0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COA3Q9Y2R0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COA3Q9Y2R0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COA3Q9Y2R0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COA3Q9Y2R0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COA3Q9Y2R0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
COA3Q9Y2R0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COA3Q9Y2R0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COA3Q9Y2R0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COA3Q9Y2R0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COA3Q9Y2R0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COA3Q9Y2R0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COA3Q9Y2R0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COA3Q9Y2R0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COA3Q9Y2R0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COA3Q9Y2R0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COA3Q9Y2R0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COA3Q9Y2R0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COA3Q9Y2R0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COA3Q9Y2R0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COA3Q9Y2R0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COA3Q9Y2R0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COA3Q9Y2R0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COA3Q9Y2R0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COA3Q9Y2R0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COA3Q9Y2R0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COA3Q9Y2R0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COA3Q9Y2R0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COA3Q9Y2R0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COA3Q9Y2R0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COA3Q9Y2R0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COA3Q9Y2R0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COA3Q9Y2R0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COA3Q9Y2R0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COA3Q9Y2R0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COA3Q9Y2R0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COA3Q9Y2R0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COA3Q9Y2R0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
COA3Q9Y2R0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COA3Q9Y2R0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COA3Q9Y2R0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COA3Q9Y2R0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COA3Q9Y2R0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COA3Q9Y2R0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COA3Q9Y2R0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COA3Q9Y2R0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COA3Q9Y2R0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COA3Q9Y2R0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COA3Q9Y2R0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COA3Q9Y2R0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
COA3Q9Y2R0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COA3Q9Y2R0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COA3Q9Y2R0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COA3Q9Y2R0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COA3Q9Y2R0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COA3Q9Y2R0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COA3Q9Y2R0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COA3Q9Y2R0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COA3Q9Y2R0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COA3Q9Y2R0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COA3Q9Y2R0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COA3Q9Y2R0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COA3Q9Y2R0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COA3Q9Y2R0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COA3Q9Y2R0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COA3Q9Y2R0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COA3Q9Y2R0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COA3Q9Y2R0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COA3Q9Y2R0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms