Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMG5Q9UPR3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMG5Q9UPR3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMG5Q9UPR3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMG5Q9UPR3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMG5Q9UPR3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMG5Q9UPR3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMG5Q9UPR3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMG5Q9UPR3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMG5Q9UPR3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMG5Q9UPR3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMG5Q9UPR3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMG5Q9UPR3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMG5Q9UPR3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMG5Q9UPR3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMG5Q9UPR3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SMG5Q9UPR3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMG5Q9UPR3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMG5Q9UPR3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMG5Q9UPR3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMG5Q9UPR3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMG5Q9UPR3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMG5Q9UPR3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMG5Q9UPR3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMG5Q9UPR3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMG5Q9UPR3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SMG5Q9UPR3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMG5Q9UPR3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMG5Q9UPR3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMG5Q9UPR3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMG5Q9UPR3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMG5Q9UPR3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMG5Q9UPR3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMG5Q9UPR3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMG5Q9UPR3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SMG5Q9UPR3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMG5Q9UPR3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMG5Q9UPR3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMG5Q9UPR3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMG5Q9UPR3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMG5Q9UPR3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMG5Q9UPR3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SMG5Q9UPR3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SMG5Q9UPR3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMG5Q9UPR3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMG5Q9UPR3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMG5Q9UPR3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMG5Q9UPR3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMG5Q9UPR3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMG5Q9UPR3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SMG5Q9UPR3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMG5Q9UPR3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMG5Q9UPR3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMG5Q9UPR3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMG5Q9UPR3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMG5Q9UPR3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMG5Q9UPR3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMG5Q9UPR3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMG5Q9UPR3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMG5Q9UPR3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMG5Q9UPR3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMG5Q9UPR3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMG5Q9UPR3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMG5Q9UPR3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMG5Q9UPR3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMG5Q9UPR3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMG5Q9UPR3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMG5Q9UPR3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SMG5Q9UPR3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMG5Q9UPR3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMG5Q9UPR3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SMG5Q9UPR3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMG5Q9UPR3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMG5Q9UPR3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMG5Q9UPR3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMG5Q9UPR3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMG5Q9UPR3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMG5Q9UPR3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SMG5Q9UPR3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMG5Q9UPR3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMG5Q9UPR3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMG5Q9UPR3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMG5Q9UPR3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMG5Q9UPR3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMG5Q9UPR3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SMG5Q9UPR3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SMG5Q9UPR3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SMG5Q9UPR3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMG5Q9UPR3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMG5Q9UPR3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMG5Q9UPR3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMG5Q9UPR3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMG5Q9UPR3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMG5Q9UPR3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SMG5Q9UPR3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMG5Q9UPR3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMG5Q9UPR3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMG5Q9UPR3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMG5Q9UPR3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMG5Q9UPR3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms