Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL2

SSR3, Translocon-associated protein subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR3Q9UNL2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSR3Q9UNL2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSR3Q9UNL2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSR3Q9UNL2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SSR3Q9UNL2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSR3Q9UNL2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSR3Q9UNL2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSR3Q9UNL2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSR3Q9UNL2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSR3Q9UNL2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSR3Q9UNL2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSR3Q9UNL2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSR3Q9UNL2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSR3Q9UNL2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSR3Q9UNL2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSR3Q9UNL2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSR3Q9UNL2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSR3Q9UNL2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSR3Q9UNL2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SSR3Q9UNL2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SSR3Q9UNL2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SSR3Q9UNL2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSR3Q9UNL2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSR3Q9UNL2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSR3Q9UNL2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSR3Q9UNL2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSR3Q9UNL2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSR3Q9UNL2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSR3Q9UNL2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSR3Q9UNL2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSR3Q9UNL2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSR3Q9UNL2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSR3Q9UNL2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSR3Q9UNL2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSR3Q9UNL2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSR3Q9UNL2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SSR3Q9UNL2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSR3Q9UNL2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSR3Q9UNL2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSR3Q9UNL2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSR3Q9UNL2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSR3Q9UNL2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSR3Q9UNL2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSR3Q9UNL2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSR3Q9UNL2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SSR3Q9UNL2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSR3Q9UNL2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSR3Q9UNL2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSR3Q9UNL2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSR3Q9UNL2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSR3Q9UNL2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSR3Q9UNL2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSR3Q9UNL2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSR3Q9UNL2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSR3Q9UNL2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSR3Q9UNL2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSR3Q9UNL2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSR3Q9UNL2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SSR3Q9UNL2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSR3Q9UNL2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSR3Q9UNL2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSR3Q9UNL2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSR3Q9UNL2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSR3Q9UNL2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSR3Q9UNL2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSR3Q9UNL2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSR3Q9UNL2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSR3Q9UNL2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSR3Q9UNL2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSR3Q9UNL2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSR3Q9UNL2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SSR3Q9UNL2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSR3Q9UNL2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SSR3Q9UNL2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSR3Q9UNL2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSR3Q9UNL2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SSR3Q9UNL2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSR3Q9UNL2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSR3Q9UNL2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SSR3Q9UNL2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSR3Q9UNL2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SSR3Q9UNL2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSR3Q9UNL2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSR3Q9UNL2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SSR3Q9UNL2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSR3Q9UNL2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSR3Q9UNL2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSR3Q9UNL2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SSR3Q9UNL2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSR3Q9UNL2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSR3Q9UNL2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SSR3Q9UNL2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SSR3Q9UNL2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SSR3Q9UNL2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SSR3Q9UNL2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSR3Q9UNL2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSR3Q9UNL2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSR3Q9UNL2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSR3Q9UNL2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SSR3Q9UNL2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms