Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM00

TMCO1, Calcium load-activated calcium channel, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO1Q9UM00 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMCO1Q9UM00 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMCO1Q9UM00 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMCO1Q9UM00 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMCO1Q9UM00 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMCO1Q9UM00 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMCO1Q9UM00 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TMCO1Q9UM00 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCO1Q9UM00 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCO1Q9UM00 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMCO1Q9UM00 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMCO1Q9UM00 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMCO1Q9UM00 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMCO1Q9UM00 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMCO1Q9UM00 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMCO1Q9UM00 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMCO1Q9UM00 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMCO1Q9UM00 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMCO1Q9UM00 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMCO1Q9UM00 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCO1Q9UM00 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCO1Q9UM00 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCO1Q9UM00 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCO1Q9UM00 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCO1Q9UM00 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCO1Q9UM00 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMCO1Q9UM00 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMCO1Q9UM00 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCO1Q9UM00 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCO1Q9UM00 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCO1Q9UM00 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCO1Q9UM00 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCO1Q9UM00 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCO1Q9UM00 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCO1Q9UM00 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMCO1Q9UM00 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMCO1Q9UM00 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMCO1Q9UM00 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMCO1Q9UM00 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TMCO1Q9UM00 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCO1Q9UM00 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCO1Q9UM00 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCO1Q9UM00 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCO1Q9UM00 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMCO1Q9UM00 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMCO1Q9UM00 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMCO1Q9UM00 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMCO1Q9UM00 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMCO1Q9UM00 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMCO1Q9UM00 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMCO1Q9UM00 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO1Q9UM00 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO1Q9UM00 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO1Q9UM00 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO1Q9UM00 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCO1Q9UM00 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO1Q9UM00 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMCO1Q9UM00 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMCO1Q9UM00 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMCO1Q9UM00 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMCO1Q9UM00 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMCO1Q9UM00 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMCO1Q9UM00 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMCO1Q9UM00 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMCO1Q9UM00 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMCO1Q9UM00 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMCO1Q9UM00 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TMCO1Q9UM00 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMCO1Q9UM00 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TMCO1Q9UM00 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMCO1Q9UM00 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TMCO1Q9UM00 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TMCO1Q9UM00 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMCO1Q9UM00 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMCO1Q9UM00 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMCO1Q9UM00 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMCO1Q9UM00 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCO1Q9UM00 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCO1Q9UM00 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCO1Q9UM00 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCO1Q9UM00 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMCO1Q9UM00 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMCO1Q9UM00 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMCO1Q9UM00 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMCO1Q9UM00 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO1Q9UM00 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO1Q9UM00 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO1Q9UM00 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMCO1Q9UM00 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMCO1Q9UM00 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMCO1Q9UM00 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO1Q9UM00 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TMCO1Q9UM00 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMCO1Q9UM00 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMCO1Q9UM00 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMCO1Q9UM00 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMCO1Q9UM00 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMCO1Q9UM00 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMCO1Q9UM00 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMCO1Q9UM00 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms