Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRID1Q9ULK0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRID1Q9ULK0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRID1Q9ULK0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRID1Q9ULK0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRID1Q9ULK0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRID1Q9ULK0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRID1Q9ULK0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRID1Q9ULK0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRID1Q9ULK0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRID1Q9ULK0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRID1Q9ULK0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRID1Q9ULK0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GRID1Q9ULK0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRID1Q9ULK0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRID1Q9ULK0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRID1Q9ULK0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRID1Q9ULK0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRID1Q9ULK0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRID1Q9ULK0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRID1Q9ULK0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRID1Q9ULK0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRID1Q9ULK0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GRID1Q9ULK0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRID1Q9ULK0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRID1Q9ULK0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRID1Q9ULK0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRID1Q9ULK0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRID1Q9ULK0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRID1Q9ULK0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRID1Q9ULK0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRID1Q9ULK0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRID1Q9ULK0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GRID1Q9ULK0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRID1Q9ULK0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRID1Q9ULK0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRID1Q9ULK0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRID1Q9ULK0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRID1Q9ULK0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRID1Q9ULK0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GRID1Q9ULK0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GRID1Q9ULK0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRID1Q9ULK0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRID1Q9ULK0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRID1Q9ULK0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRID1Q9ULK0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRID1Q9ULK0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRID1Q9ULK0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRID1Q9ULK0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRID1Q9ULK0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRID1Q9ULK0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRID1Q9ULK0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRID1Q9ULK0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRID1Q9ULK0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRID1Q9ULK0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRID1Q9ULK0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRID1Q9ULK0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRID1Q9ULK0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRID1Q9ULK0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRID1Q9ULK0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRID1Q9ULK0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRID1Q9ULK0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRID1Q9ULK0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRID1Q9ULK0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRID1Q9ULK0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRID1Q9ULK0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRID1Q9ULK0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRID1Q9ULK0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRID1Q9ULK0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRID1Q9ULK0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRID1Q9ULK0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRID1Q9ULK0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRID1Q9ULK0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRID1Q9ULK0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRID1Q9ULK0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRID1Q9ULK0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRID1Q9ULK0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRID1Q9ULK0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRID1Q9ULK0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRID1Q9ULK0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRID1Q9ULK0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRID1Q9ULK0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRID1Q9ULK0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GRID1Q9ULK0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRID1Q9ULK0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRID1Q9ULK0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRID1Q9ULK0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRID1Q9ULK0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRID1Q9ULK0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GRID1Q9ULK0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRID1Q9ULK0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRID1Q9ULK0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRID1Q9ULK0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRID1Q9ULK0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRID1Q9ULK0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRID1Q9ULK0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRID1Q9ULK0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRID1Q9ULK0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRID1Q9ULK0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRID1Q9ULK0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms