Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRTO4Q9UKD2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRTO4Q9UKD2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRTO4Q9UKD2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRTO4Q9UKD2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRTO4Q9UKD2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRTO4Q9UKD2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRTO4Q9UKD2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRTO4Q9UKD2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRTO4Q9UKD2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRTO4Q9UKD2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRTO4Q9UKD2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRTO4Q9UKD2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRTO4Q9UKD2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MRTO4Q9UKD2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRTO4Q9UKD2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRTO4Q9UKD2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRTO4Q9UKD2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRTO4Q9UKD2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRTO4Q9UKD2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRTO4Q9UKD2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRTO4Q9UKD2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MRTO4Q9UKD2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRTO4Q9UKD2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRTO4Q9UKD2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRTO4Q9UKD2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRTO4Q9UKD2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRTO4Q9UKD2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRTO4Q9UKD2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRTO4Q9UKD2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRTO4Q9UKD2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRTO4Q9UKD2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRTO4Q9UKD2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRTO4Q9UKD2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRTO4Q9UKD2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRTO4Q9UKD2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MRTO4Q9UKD2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRTO4Q9UKD2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MRTO4Q9UKD2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MRTO4Q9UKD2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRTO4Q9UKD2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRTO4Q9UKD2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRTO4Q9UKD2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRTO4Q9UKD2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRTO4Q9UKD2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRTO4Q9UKD2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRTO4Q9UKD2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRTO4Q9UKD2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRTO4Q9UKD2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MRTO4Q9UKD2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
MRTO4Q9UKD2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRTO4Q9UKD2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRTO4Q9UKD2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRTO4Q9UKD2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRTO4Q9UKD2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRTO4Q9UKD2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRTO4Q9UKD2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRTO4Q9UKD2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRTO4Q9UKD2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRTO4Q9UKD2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRTO4Q9UKD2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRTO4Q9UKD2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRTO4Q9UKD2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRTO4Q9UKD2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRTO4Q9UKD2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRTO4Q9UKD2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRTO4Q9UKD2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRTO4Q9UKD2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRTO4Q9UKD2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRTO4Q9UKD2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MRTO4Q9UKD2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MRTO4Q9UKD2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRTO4Q9UKD2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRTO4Q9UKD2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRTO4Q9UKD2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRTO4Q9UKD2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRTO4Q9UKD2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRTO4Q9UKD2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRTO4Q9UKD2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRTO4Q9UKD2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRTO4Q9UKD2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRTO4Q9UKD2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRTO4Q9UKD2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRTO4Q9UKD2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRTO4Q9UKD2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRTO4Q9UKD2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRTO4Q9UKD2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRTO4Q9UKD2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRTO4Q9UKD2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRTO4Q9UKD2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRTO4Q9UKD2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRTO4Q9UKD2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRTO4Q9UKD2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRTO4Q9UKD2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRTO4Q9UKD2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRTO4Q9UKD2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRTO4Q9UKD2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRTO4Q9UKD2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MRTO4Q9UKD2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRTO4Q9UKD2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.6 ms