Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEFF2Q9UIK5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEFF2Q9UIK5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEFF2Q9UIK5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEFF2Q9UIK5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEFF2Q9UIK5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEFF2Q9UIK5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEFF2Q9UIK5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEFF2Q9UIK5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEFF2Q9UIK5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEFF2Q9UIK5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEFF2Q9UIK5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEFF2Q9UIK5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEFF2Q9UIK5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEFF2Q9UIK5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEFF2Q9UIK5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEFF2Q9UIK5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEFF2Q9UIK5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEFF2Q9UIK5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEFF2Q9UIK5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEFF2Q9UIK5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEFF2Q9UIK5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEFF2Q9UIK5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEFF2Q9UIK5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEFF2Q9UIK5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEFF2Q9UIK5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEFF2Q9UIK5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEFF2Q9UIK5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEFF2Q9UIK5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEFF2Q9UIK5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEFF2Q9UIK5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEFF2Q9UIK5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEFF2Q9UIK5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEFF2Q9UIK5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEFF2Q9UIK5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEFF2Q9UIK5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEFF2Q9UIK5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEFF2Q9UIK5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEFF2Q9UIK5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEFF2Q9UIK5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEFF2Q9UIK5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEFF2Q9UIK5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEFF2Q9UIK5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEFF2Q9UIK5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEFF2Q9UIK5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEFF2Q9UIK5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEFF2Q9UIK5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEFF2Q9UIK5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEFF2Q9UIK5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEFF2Q9UIK5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEFF2Q9UIK5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEFF2Q9UIK5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEFF2Q9UIK5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEFF2Q9UIK5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEFF2Q9UIK5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEFF2Q9UIK5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEFF2Q9UIK5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEFF2Q9UIK5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEFF2Q9UIK5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEFF2Q9UIK5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEFF2Q9UIK5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEFF2Q9UIK5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEFF2Q9UIK5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEFF2Q9UIK5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEFF2Q9UIK5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEFF2Q9UIK5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEFF2Q9UIK5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEFF2Q9UIK5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEFF2Q9UIK5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEFF2Q9UIK5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEFF2Q9UIK5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEFF2Q9UIK5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEFF2Q9UIK5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEFF2Q9UIK5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEFF2Q9UIK5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEFF2Q9UIK5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEFF2Q9UIK5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEFF2Q9UIK5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEFF2Q9UIK5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEFF2Q9UIK5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEFF2Q9UIK5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEFF2Q9UIK5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEFF2Q9UIK5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEFF2Q9UIK5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEFF2Q9UIK5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEFF2Q9UIK5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEFF2Q9UIK5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEFF2Q9UIK5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEFF2Q9UIK5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEFF2Q9UIK5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEFF2Q9UIK5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEFF2Q9UIK5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEFF2Q9UIK5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEFF2Q9UIK5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEFF2Q9UIK5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEFF2Q9UIK5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEFF2Q9UIK5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEFF2Q9UIK5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEFF2Q9UIK5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMEFF2Q9UIK5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms