Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI09

NDUFA12, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA12Q9UI09 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NDUFA12Q9UI09 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NDUFA12Q9UI09 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NDUFA12Q9UI09 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NDUFA12Q9UI09 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NDUFA12Q9UI09 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NDUFA12Q9UI09 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NDUFA12Q9UI09 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NDUFA12Q9UI09 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NDUFA12Q9UI09 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NDUFA12Q9UI09 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NDUFA12Q9UI09 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA12Q9UI09 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA12Q9UI09 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NDUFA12Q9UI09 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NDUFA12Q9UI09 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA12Q9UI09 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NDUFA12Q9UI09 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA12Q9UI09 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA12Q9UI09 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA12Q9UI09 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA12Q9UI09 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA12Q9UI09 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NDUFA12Q9UI09 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA12Q9UI09 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA12Q9UI09 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA12Q9UI09 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA12Q9UI09 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA12Q9UI09 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA12Q9UI09 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NDUFA12Q9UI09 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFA12Q9UI09 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFA12Q9UI09 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFA12Q9UI09 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFA12Q9UI09 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NDUFA12Q9UI09 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA12Q9UI09 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA12Q9UI09 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NDUFA12Q9UI09 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NDUFA12Q9UI09 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFA12Q9UI09 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFA12Q9UI09 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFA12Q9UI09 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NDUFA12Q9UI09 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA12Q9UI09 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA12Q9UI09 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA12Q9UI09 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA12Q9UI09 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA12Q9UI09 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA12Q9UI09 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA12Q9UI09 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA12Q9UI09 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NDUFA12Q9UI09 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA12Q9UI09 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA12Q9UI09 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA12Q9UI09 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA12Q9UI09 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NDUFA12Q9UI09 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NDUFA12Q9UI09 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFA12Q9UI09 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NDUFA12Q9UI09 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA12Q9UI09 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA12Q9UI09 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA12Q9UI09 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NDUFA12Q9UI09 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA12Q9UI09 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NDUFA12Q9UI09 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NDUFA12Q9UI09 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA12Q9UI09 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NDUFA12Q9UI09 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA12Q9UI09 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA12Q9UI09 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA12Q9UI09 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA12Q9UI09 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NDUFA12Q9UI09 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA12Q9UI09 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NDUFA12Q9UI09 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFA12Q9UI09 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFA12Q9UI09 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFA12Q9UI09 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFA12Q9UI09 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NDUFA12Q9UI09 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDUFA12Q9UI09 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDUFA12Q9UI09 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDUFA12Q9UI09 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NDUFA12Q9UI09 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDUFA12Q9UI09 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NDUFA12Q9UI09 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDUFA12Q9UI09 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDUFA12Q9UI09 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDUFA12Q9UI09 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDUFA12Q9UI09 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDUFA12Q9UI09 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NDUFA12Q9UI09 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA12Q9UI09 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA12Q9UI09 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA12Q9UI09 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA12Q9UI09 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA12Q9UI09 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NDUFA12Q9UI09 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms