Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FBXO40Q9UH90 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FBXO40Q9UH90 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FBXO40Q9UH90 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
FBXO40Q9UH90 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
FBXO40Q9UH90 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
FBXO40Q9UH90 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FBXO40Q9UH90 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
FBXO40Q9UH90 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
FBXO40Q9UH90 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FBXO40Q9UH90 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FBXO40Q9UH90 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FBXO40Q9UH90 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FBXO40Q9UH90 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FBXO40Q9UH90 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FBXO40Q9UH90 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
FBXO40Q9UH90 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FBXO40Q9UH90 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FBXO40Q9UH90 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FBXO40Q9UH90 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
FBXO40Q9UH90 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FBXO40Q9UH90 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FBXO40Q9UH90 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
FBXO40Q9UH90 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
FBXO40Q9UH90 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
FBXO40Q9UH90 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
FBXO40Q9UH90 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FBXO40Q9UH90 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FBXO40Q9UH90 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FBXO40Q9UH90 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FBXO40Q9UH90 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FBXO40Q9UH90 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
FBXO40Q9UH90 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FBXO40Q9UH90 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
FBXO40Q9UH90 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FBXO40Q9UH90 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FBXO40Q9UH90 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FBXO40Q9UH90 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FBXO40Q9UH90 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FBXO40Q9UH90 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
FBXO40Q9UH90 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FBXO40Q9UH90 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
FBXO40Q9UH90 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
FBXO40Q9UH90 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
FBXO40Q9UH90 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
FBXO40Q9UH90 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
FBXO40Q9UH90 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
FBXO40Q9UH90 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
FBXO40Q9UH90 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
FBXO40Q9UH90 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
FBXO40Q9UH90 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FBXO40Q9UH90 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FBXO40Q9UH90 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FBXO40Q9UH90 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FBXO40Q9UH90 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FBXO40Q9UH90 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FBXO40Q9UH90 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FBXO40Q9UH90 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FBXO40Q9UH90 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FBXO40Q9UH90 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FBXO40Q9UH90 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FBXO40Q9UH90 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FBXO40Q9UH90 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FBXO40Q9UH90 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FBXO40Q9UH90 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FBXO40Q9UH90 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FBXO40Q9UH90 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
FBXO40Q9UH90 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FBXO40Q9UH90 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FBXO40Q9UH90 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FBXO40Q9UH90 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FBXO40Q9UH90 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FBXO40Q9UH90 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FBXO40Q9UH90 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FBXO40Q9UH90 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FBXO40Q9UH90 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FBXO40Q9UH90 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FBXO40Q9UH90 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FBXO40Q9UH90 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FBXO40Q9UH90 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FBXO40Q9UH90 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FBXO40Q9UH90 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
FBXO40Q9UH90 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
FBXO40Q9UH90 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FBXO40Q9UH90 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FBXO40Q9UH90 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
FBXO40Q9UH90 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
FBXO40Q9UH90 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FBXO40Q9UH90 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FBXO40Q9UH90 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FBXO40Q9UH90 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FBXO40Q9UH90 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FBXO40Q9UH90 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FBXO40Q9UH90 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FBXO40Q9UH90 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FBXO40Q9UH90 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FBXO40Q9UH90 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FBXO40Q9UH90 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FBXO40Q9UH90 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FBXO40Q9UH90 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms