Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NXF1Q9UBU9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NXF1Q9UBU9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NXF1Q9UBU9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NXF1Q9UBU9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NXF1Q9UBU9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NXF1Q9UBU9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NXF1Q9UBU9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NXF1Q9UBU9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NXF1Q9UBU9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NXF1Q9UBU9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NXF1Q9UBU9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NXF1Q9UBU9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NXF1Q9UBU9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NXF1Q9UBU9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NXF1Q9UBU9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NXF1Q9UBU9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NXF1Q9UBU9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NXF1Q9UBU9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NXF1Q9UBU9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NXF1Q9UBU9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NXF1Q9UBU9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NXF1Q9UBU9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NXF1Q9UBU9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NXF1Q9UBU9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NXF1Q9UBU9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NXF1Q9UBU9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NXF1Q9UBU9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NXF1Q9UBU9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NXF1Q9UBU9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NXF1Q9UBU9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NXF1Q9UBU9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NXF1Q9UBU9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NXF1Q9UBU9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NXF1Q9UBU9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NXF1Q9UBU9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NXF1Q9UBU9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NXF1Q9UBU9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NXF1Q9UBU9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NXF1Q9UBU9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NXF1Q9UBU9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NXF1Q9UBU9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NXF1Q9UBU9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NXF1Q9UBU9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NXF1Q9UBU9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NXF1Q9UBU9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NXF1Q9UBU9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NXF1Q9UBU9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NXF1Q9UBU9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NXF1Q9UBU9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NXF1Q9UBU9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NXF1Q9UBU9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NXF1Q9UBU9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NXF1Q9UBU9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NXF1Q9UBU9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NXF1Q9UBU9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NXF1Q9UBU9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NXF1Q9UBU9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NXF1Q9UBU9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NXF1Q9UBU9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NXF1Q9UBU9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NXF1Q9UBU9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NXF1Q9UBU9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NXF1Q9UBU9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NXF1Q9UBU9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NXF1Q9UBU9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NXF1Q9UBU9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NXF1Q9UBU9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NXF1Q9UBU9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NXF1Q9UBU9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NXF1Q9UBU9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NXF1Q9UBU9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NXF1Q9UBU9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NXF1Q9UBU9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NXF1Q9UBU9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NXF1Q9UBU9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NXF1Q9UBU9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NXF1Q9UBU9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NXF1Q9UBU9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NXF1Q9UBU9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NXF1Q9UBU9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NXF1Q9UBU9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NXF1Q9UBU9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NXF1Q9UBU9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NXF1Q9UBU9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NXF1Q9UBU9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NXF1Q9UBU9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NXF1Q9UBU9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NXF1Q9UBU9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NXF1Q9UBU9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NXF1Q9UBU9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NXF1Q9UBU9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NXF1Q9UBU9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NXF1Q9UBU9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NXF1Q9UBU9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NXF1Q9UBU9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NXF1Q9UBU9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NXF1Q9UBU9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NXF1Q9UBU9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NXF1Q9UBU9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.6 ms