Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DKK2Q9UBU2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DKK2Q9UBU2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DKK2Q9UBU2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DKK2Q9UBU2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DKK2Q9UBU2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DKK2Q9UBU2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DKK2Q9UBU2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DKK2Q9UBU2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DKK2Q9UBU2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DKK2Q9UBU2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DKK2Q9UBU2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DKK2Q9UBU2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DKK2Q9UBU2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DKK2Q9UBU2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DKK2Q9UBU2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DKK2Q9UBU2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DKK2Q9UBU2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DKK2Q9UBU2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DKK2Q9UBU2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DKK2Q9UBU2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DKK2Q9UBU2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DKK2Q9UBU2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DKK2Q9UBU2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DKK2Q9UBU2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DKK2Q9UBU2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DKK2Q9UBU2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DKK2Q9UBU2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DKK2Q9UBU2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DKK2Q9UBU2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DKK2Q9UBU2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DKK2Q9UBU2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DKK2Q9UBU2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DKK2Q9UBU2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DKK2Q9UBU2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DKK2Q9UBU2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DKK2Q9UBU2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DKK2Q9UBU2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DKK2Q9UBU2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DKK2Q9UBU2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DKK2Q9UBU2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DKK2Q9UBU2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DKK2Q9UBU2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DKK2Q9UBU2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DKK2Q9UBU2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DKK2Q9UBU2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DKK2Q9UBU2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DKK2Q9UBU2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DKK2Q9UBU2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DKK2Q9UBU2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DKK2Q9UBU2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DKK2Q9UBU2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DKK2Q9UBU2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DKK2Q9UBU2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DKK2Q9UBU2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DKK2Q9UBU2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DKK2Q9UBU2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DKK2Q9UBU2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DKK2Q9UBU2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DKK2Q9UBU2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DKK2Q9UBU2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DKK2Q9UBU2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DKK2Q9UBU2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DKK2Q9UBU2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DKK2Q9UBU2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DKK2Q9UBU2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DKK2Q9UBU2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DKK2Q9UBU2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DKK2Q9UBU2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DKK2Q9UBU2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DKK2Q9UBU2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DKK2Q9UBU2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DKK2Q9UBU2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DKK2Q9UBU2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DKK2Q9UBU2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DKK2Q9UBU2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DKK2Q9UBU2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DKK2Q9UBU2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DKK2Q9UBU2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DKK2Q9UBU2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DKK2Q9UBU2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DKK2Q9UBU2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DKK2Q9UBU2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DKK2Q9UBU2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DKK2Q9UBU2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DKK2Q9UBU2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DKK2Q9UBU2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DKK2Q9UBU2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK2Q9UBU2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DKK2Q9UBU2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK2Q9UBU2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK2Q9UBU2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DKK2Q9UBU2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK2Q9UBU2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK2Q9UBU2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK2Q9UBU2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK2Q9UBU2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK2Q9UBU2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK2Q9UBU2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DKK2Q9UBU2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms