Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNNAL1Q9UBT7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTNNAL1Q9UBT7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTNNAL1Q9UBT7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTNNAL1Q9UBT7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CTNNAL1Q9UBT7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTNNAL1Q9UBT7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTNNAL1Q9UBT7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTNNAL1Q9UBT7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTNNAL1Q9UBT7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTNNAL1Q9UBT7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTNNAL1Q9UBT7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTNNAL1Q9UBT7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTNNAL1Q9UBT7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTNNAL1Q9UBT7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTNNAL1Q9UBT7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTNNAL1Q9UBT7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTNNAL1Q9UBT7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTNNAL1Q9UBT7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTNNAL1Q9UBT7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTNNAL1Q9UBT7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTNNAL1Q9UBT7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTNNAL1Q9UBT7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTNNAL1Q9UBT7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTNNAL1Q9UBT7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTNNAL1Q9UBT7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTNNAL1Q9UBT7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTNNAL1Q9UBT7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTNNAL1Q9UBT7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTNNAL1Q9UBT7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTNNAL1Q9UBT7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTNNAL1Q9UBT7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTNNAL1Q9UBT7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTNNAL1Q9UBT7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTNNAL1Q9UBT7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTNNAL1Q9UBT7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTNNAL1Q9UBT7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTNNAL1Q9UBT7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTNNAL1Q9UBT7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTNNAL1Q9UBT7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTNNAL1Q9UBT7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTNNAL1Q9UBT7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CTNNAL1Q9UBT7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTNNAL1Q9UBT7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTNNAL1Q9UBT7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTNNAL1Q9UBT7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTNNAL1Q9UBT7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTNNAL1Q9UBT7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTNNAL1Q9UBT7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTNNAL1Q9UBT7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNNAL1Q9UBT7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNNAL1Q9UBT7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNNAL1Q9UBT7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNNAL1Q9UBT7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNNAL1Q9UBT7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNNAL1Q9UBT7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTNNAL1Q9UBT7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTNNAL1Q9UBT7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CTNNAL1Q9UBT7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTNNAL1Q9UBT7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTNNAL1Q9UBT7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTNNAL1Q9UBT7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTNNAL1Q9UBT7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTNNAL1Q9UBT7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTNNAL1Q9UBT7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTNNAL1Q9UBT7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CTNNAL1Q9UBT7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTNNAL1Q9UBT7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CTNNAL1Q9UBT7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTNNAL1Q9UBT7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTNNAL1Q9UBT7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTNNAL1Q9UBT7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTNNAL1Q9UBT7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTNNAL1Q9UBT7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTNNAL1Q9UBT7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTNNAL1Q9UBT7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTNNAL1Q9UBT7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTNNAL1Q9UBT7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTNNAL1Q9UBT7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTNNAL1Q9UBT7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTNNAL1Q9UBT7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTNNAL1Q9UBT7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CTNNAL1Q9UBT7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTNNAL1Q9UBT7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTNNAL1Q9UBT7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTNNAL1Q9UBT7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTNNAL1Q9UBT7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTNNAL1Q9UBT7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTNNAL1Q9UBT7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTNNAL1Q9UBT7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTNNAL1Q9UBT7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTNNAL1Q9UBT7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTNNAL1Q9UBT7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTNNAL1Q9UBT7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms