Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
POLKQ9UBT6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
POLKQ9UBT6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
POLKQ9UBT6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
POLKQ9UBT6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
POLKQ9UBT6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
POLKQ9UBT6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
POLKQ9UBT6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
POLKQ9UBT6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
POLKQ9UBT6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
POLKQ9UBT6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
POLKQ9UBT6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
POLKQ9UBT6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
POLKQ9UBT6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
POLKQ9UBT6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
POLKQ9UBT6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
POLKQ9UBT6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
POLKQ9UBT6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
POLKQ9UBT6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
POLKQ9UBT6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
POLKQ9UBT6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
POLKQ9UBT6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
POLKQ9UBT6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
POLKQ9UBT6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
POLKQ9UBT6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
POLKQ9UBT6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
POLKQ9UBT6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
POLKQ9UBT6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC35.49■■■■□ 3.27
POLKQ9UBT6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
POLKQ9UBT6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
POLKQ9UBT6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
POLKQ9UBT6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
POLKQ9UBT6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
POLKQ9UBT6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
POLKQ9UBT6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
POLKQ9UBT6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
POLKQ9UBT6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
POLKQ9UBT6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
POLKQ9UBT6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
POLKQ9UBT6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
POLKQ9UBT6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
POLKQ9UBT6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
POLKQ9UBT6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
POLKQ9UBT6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
POLKQ9UBT6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
POLKQ9UBT6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
POLKQ9UBT6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
POLKQ9UBT6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
POLKQ9UBT6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
POLKQ9UBT6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
POLKQ9UBT6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
POLKQ9UBT6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
POLKQ9UBT6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
POLKQ9UBT6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
POLKQ9UBT6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
POLKQ9UBT6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
POLKQ9UBT6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
POLKQ9UBT6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
POLKQ9UBT6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
POLKQ9UBT6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
POLKQ9UBT6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
POLKQ9UBT6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC35.33■■■■□ 3.25
POLKQ9UBT6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
POLKQ9UBT6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
POLKQ9UBT6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC35.31■■■■□ 3.24
POLKQ9UBT6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
POLKQ9UBT6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
POLKQ9UBT6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
POLKQ9UBT6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
POLKQ9UBT6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
POLKQ9UBT6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
POLKQ9UBT6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
POLKQ9UBT6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
POLKQ9UBT6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
POLKQ9UBT6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
POLKQ9UBT6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
POLKQ9UBT6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
POLKQ9UBT6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
POLKQ9UBT6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
POLKQ9UBT6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
POLKQ9UBT6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
POLKQ9UBT6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
POLKQ9UBT6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
POLKQ9UBT6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC35.23■■■■□ 3.23
POLKQ9UBT6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
POLKQ9UBT6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
POLKQ9UBT6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
POLKQ9UBT6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
POLKQ9UBT6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
POLKQ9UBT6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
POLKQ9UBT6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
POLKQ9UBT6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
POLKQ9UBT6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
POLKQ9UBT6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
POLKQ9UBT6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
POLKQ9UBT6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
POLKQ9UBT6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
POLKQ9UBT6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
POLKQ9UBT6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
POLKQ9UBT6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms