Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPB1Q9UBR1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPB1Q9UBR1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPB1Q9UBR1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPB1Q9UBR1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPB1Q9UBR1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPB1Q9UBR1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPB1Q9UBR1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPB1Q9UBR1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPB1Q9UBR1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UPB1Q9UBR1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPB1Q9UBR1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPB1Q9UBR1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UPB1Q9UBR1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPB1Q9UBR1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPB1Q9UBR1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPB1Q9UBR1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPB1Q9UBR1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPB1Q9UBR1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPB1Q9UBR1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPB1Q9UBR1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPB1Q9UBR1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPB1Q9UBR1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPB1Q9UBR1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UPB1Q9UBR1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPB1Q9UBR1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPB1Q9UBR1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPB1Q9UBR1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPB1Q9UBR1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPB1Q9UBR1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPB1Q9UBR1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UPB1Q9UBR1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPB1Q9UBR1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPB1Q9UBR1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPB1Q9UBR1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPB1Q9UBR1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPB1Q9UBR1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPB1Q9UBR1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPB1Q9UBR1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPB1Q9UBR1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPB1Q9UBR1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPB1Q9UBR1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPB1Q9UBR1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPB1Q9UBR1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPB1Q9UBR1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPB1Q9UBR1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPB1Q9UBR1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPB1Q9UBR1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPB1Q9UBR1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UPB1Q9UBR1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UPB1Q9UBR1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UPB1Q9UBR1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UPB1Q9UBR1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UPB1Q9UBR1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UPB1Q9UBR1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UPB1Q9UBR1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UPB1Q9UBR1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UPB1Q9UBR1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UPB1Q9UBR1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UPB1Q9UBR1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UPB1Q9UBR1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UPB1Q9UBR1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UPB1Q9UBR1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPB1Q9UBR1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPB1Q9UBR1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPB1Q9UBR1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPB1Q9UBR1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPB1Q9UBR1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPB1Q9UBR1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPB1Q9UBR1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPB1Q9UBR1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPB1Q9UBR1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPB1Q9UBR1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPB1Q9UBR1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UPB1Q9UBR1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPB1Q9UBR1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPB1Q9UBR1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPB1Q9UBR1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPB1Q9UBR1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UPB1Q9UBR1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPB1Q9UBR1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPB1Q9UBR1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPB1Q9UBR1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPB1Q9UBR1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPB1Q9UBR1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPB1Q9UBR1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPB1Q9UBR1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPB1Q9UBR1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPB1Q9UBR1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPB1Q9UBR1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPB1Q9UBR1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPB1Q9UBR1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPB1Q9UBR1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPB1Q9UBR1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPB1Q9UBR1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UPB1Q9UBR1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UPB1Q9UBR1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPB1Q9UBR1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPB1Q9UBR1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPB1Q9UBR1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms