Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNG4Q9UBN1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNG4Q9UBN1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNG4Q9UBN1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CACNG4Q9UBN1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CACNG4Q9UBN1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CACNG4Q9UBN1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CACNG4Q9UBN1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CACNG4Q9UBN1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CACNG4Q9UBN1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CACNG4Q9UBN1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CACNG4Q9UBN1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CACNG4Q9UBN1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CACNG4Q9UBN1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CACNG4Q9UBN1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CACNG4Q9UBN1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNG4Q9UBN1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNG4Q9UBN1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNG4Q9UBN1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNG4Q9UBN1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNG4Q9UBN1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNG4Q9UBN1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNG4Q9UBN1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CACNG4Q9UBN1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CACNG4Q9UBN1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CACNG4Q9UBN1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNG4Q9UBN1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNG4Q9UBN1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNG4Q9UBN1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNG4Q9UBN1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CACNG4Q9UBN1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CACNG4Q9UBN1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNG4Q9UBN1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNG4Q9UBN1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNG4Q9UBN1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNG4Q9UBN1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNG4Q9UBN1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNG4Q9UBN1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNG4Q9UBN1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNG4Q9UBN1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNG4Q9UBN1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNG4Q9UBN1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNG4Q9UBN1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNG4Q9UBN1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNG4Q9UBN1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNG4Q9UBN1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNG4Q9UBN1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNG4Q9UBN1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNG4Q9UBN1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNG4Q9UBN1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNG4Q9UBN1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CACNG4Q9UBN1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CACNG4Q9UBN1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CACNG4Q9UBN1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CACNG4Q9UBN1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CACNG4Q9UBN1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CACNG4Q9UBN1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CACNG4Q9UBN1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CACNG4Q9UBN1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CACNG4Q9UBN1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CACNG4Q9UBN1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNG4Q9UBN1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNG4Q9UBN1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CACNG4Q9UBN1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CACNG4Q9UBN1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CACNG4Q9UBN1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CACNG4Q9UBN1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CACNG4Q9UBN1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNG4Q9UBN1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNG4Q9UBN1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNG4Q9UBN1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNG4Q9UBN1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNG4Q9UBN1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CACNG4Q9UBN1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CACNG4Q9UBN1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CACNG4Q9UBN1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CACNG4Q9UBN1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNG4Q9UBN1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNG4Q9UBN1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNG4Q9UBN1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNG4Q9UBN1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNG4Q9UBN1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNG4Q9UBN1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNG4Q9UBN1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNG4Q9UBN1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNG4Q9UBN1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNG4Q9UBN1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNG4Q9UBN1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNG4Q9UBN1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNG4Q9UBN1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CACNG4Q9UBN1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNG4Q9UBN1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNG4Q9UBN1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNG4Q9UBN1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNG4Q9UBN1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CACNG4Q9UBN1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CACNG4Q9UBN1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CACNG4Q9UBN1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CACNG4Q9UBN1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CACNG4Q9UBN1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms