Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC9

SPRR3, Small proline-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR3Q9UBC9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRR3Q9UBC9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPRR3Q9UBC9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPRR3Q9UBC9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPRR3Q9UBC9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SPRR3Q9UBC9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPRR3Q9UBC9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPRR3Q9UBC9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPRR3Q9UBC9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPRR3Q9UBC9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRR3Q9UBC9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRR3Q9UBC9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRR3Q9UBC9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRR3Q9UBC9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRR3Q9UBC9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPRR3Q9UBC9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPRR3Q9UBC9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRR3Q9UBC9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRR3Q9UBC9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPRR3Q9UBC9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRR3Q9UBC9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRR3Q9UBC9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRR3Q9UBC9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPRR3Q9UBC9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPRR3Q9UBC9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPRR3Q9UBC9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRR3Q9UBC9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPRR3Q9UBC9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRR3Q9UBC9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRR3Q9UBC9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRR3Q9UBC9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRR3Q9UBC9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPRR3Q9UBC9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPRR3Q9UBC9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPRR3Q9UBC9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPRR3Q9UBC9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPRR3Q9UBC9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRR3Q9UBC9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRR3Q9UBC9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRR3Q9UBC9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPRR3Q9UBC9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRR3Q9UBC9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRR3Q9UBC9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRR3Q9UBC9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRR3Q9UBC9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SPRR3Q9UBC9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPRR3Q9UBC9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRR3Q9UBC9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRR3Q9UBC9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPRR3Q9UBC9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRR3Q9UBC9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRR3Q9UBC9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRR3Q9UBC9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRR3Q9UBC9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRR3Q9UBC9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRR3Q9UBC9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRR3Q9UBC9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRR3Q9UBC9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRR3Q9UBC9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRR3Q9UBC9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRR3Q9UBC9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRR3Q9UBC9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRR3Q9UBC9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRR3Q9UBC9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRR3Q9UBC9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRR3Q9UBC9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPRR3Q9UBC9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPRR3Q9UBC9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPRR3Q9UBC9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPRR3Q9UBC9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPRR3Q9UBC9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPRR3Q9UBC9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPRR3Q9UBC9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPRR3Q9UBC9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms