Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC17A6Q9P2U8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC17A6Q9P2U8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC17A6Q9P2U8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC17A6Q9P2U8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC17A6Q9P2U8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC17A6Q9P2U8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC17A6Q9P2U8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC17A6Q9P2U8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC17A6Q9P2U8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC17A6Q9P2U8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC17A6Q9P2U8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC17A6Q9P2U8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC17A6Q9P2U8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC17A6Q9P2U8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC17A6Q9P2U8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC17A6Q9P2U8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC17A6Q9P2U8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC17A6Q9P2U8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC17A6Q9P2U8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC17A6Q9P2U8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC17A6Q9P2U8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC17A6Q9P2U8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC17A6Q9P2U8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC17A6Q9P2U8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC17A6Q9P2U8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC17A6Q9P2U8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC17A6Q9P2U8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC17A6Q9P2U8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC17A6Q9P2U8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC17A6Q9P2U8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC17A6Q9P2U8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC17A6Q9P2U8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC17A6Q9P2U8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC17A6Q9P2U8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC17A6Q9P2U8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC17A6Q9P2U8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC17A6Q9P2U8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC17A6Q9P2U8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC17A6Q9P2U8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC17A6Q9P2U8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC17A6Q9P2U8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC17A6Q9P2U8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC17A6Q9P2U8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC17A6Q9P2U8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC17A6Q9P2U8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC17A6Q9P2U8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC17A6Q9P2U8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC17A6Q9P2U8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC17A6Q9P2U8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC17A6Q9P2U8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC17A6Q9P2U8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC17A6Q9P2U8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC17A6Q9P2U8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC17A6Q9P2U8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC17A6Q9P2U8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC17A6Q9P2U8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC17A6Q9P2U8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC17A6Q9P2U8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC17A6Q9P2U8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC17A6Q9P2U8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC17A6Q9P2U8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC17A6Q9P2U8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC17A6Q9P2U8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC17A6Q9P2U8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC17A6Q9P2U8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC17A6Q9P2U8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC17A6Q9P2U8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC17A6Q9P2U8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC17A6Q9P2U8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC17A6Q9P2U8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC17A6Q9P2U8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC17A6Q9P2U8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC17A6Q9P2U8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC17A6Q9P2U8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC17A6Q9P2U8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC17A6Q9P2U8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC17A6Q9P2U8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC17A6Q9P2U8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC17A6Q9P2U8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC17A6Q9P2U8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC17A6Q9P2U8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC17A6Q9P2U8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC17A6Q9P2U8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC17A6Q9P2U8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC17A6Q9P2U8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC17A6Q9P2U8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC17A6Q9P2U8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC17A6Q9P2U8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC17A6Q9P2U8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC17A6Q9P2U8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC17A6Q9P2U8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC17A6Q9P2U8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC17A6Q9P2U8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC17A6Q9P2U8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC17A6Q9P2U8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC17A6Q9P2U8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC17A6Q9P2U8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC17A6Q9P2U8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC17A6Q9P2U8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms