Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UBP1Q9NZI7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBP1Q9NZI7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBP1Q9NZI7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UBP1Q9NZI7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBP1Q9NZI7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBP1Q9NZI7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBP1Q9NZI7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UBP1Q9NZI7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBP1Q9NZI7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBP1Q9NZI7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBP1Q9NZI7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBP1Q9NZI7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBP1Q9NZI7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
UBP1Q9NZI7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBP1Q9NZI7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBP1Q9NZI7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBP1Q9NZI7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBP1Q9NZI7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBP1Q9NZI7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBP1Q9NZI7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBP1Q9NZI7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBP1Q9NZI7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBP1Q9NZI7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBP1Q9NZI7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBP1Q9NZI7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBP1Q9NZI7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBP1Q9NZI7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBP1Q9NZI7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBP1Q9NZI7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBP1Q9NZI7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
UBP1Q9NZI7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBP1Q9NZI7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBP1Q9NZI7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBP1Q9NZI7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBP1Q9NZI7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBP1Q9NZI7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBP1Q9NZI7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBP1Q9NZI7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBP1Q9NZI7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBP1Q9NZI7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBP1Q9NZI7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBP1Q9NZI7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBP1Q9NZI7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBP1Q9NZI7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBP1Q9NZI7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBP1Q9NZI7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBP1Q9NZI7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBP1Q9NZI7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBP1Q9NZI7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBP1Q9NZI7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBP1Q9NZI7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBP1Q9NZI7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
UBP1Q9NZI7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBP1Q9NZI7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBP1Q9NZI7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBP1Q9NZI7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBP1Q9NZI7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBP1Q9NZI7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBP1Q9NZI7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBP1Q9NZI7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBP1Q9NZI7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBP1Q9NZI7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBP1Q9NZI7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBP1Q9NZI7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBP1Q9NZI7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBP1Q9NZI7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBP1Q9NZI7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBP1Q9NZI7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBP1Q9NZI7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBP1Q9NZI7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBP1Q9NZI7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBP1Q9NZI7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBP1Q9NZI7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBP1Q9NZI7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBP1Q9NZI7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBP1Q9NZI7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
UBP1Q9NZI7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBP1Q9NZI7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBP1Q9NZI7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBP1Q9NZI7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBP1Q9NZI7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UBP1Q9NZI7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBP1Q9NZI7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBP1Q9NZI7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
UBP1Q9NZI7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBP1Q9NZI7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBP1Q9NZI7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
UBP1Q9NZI7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBP1Q9NZI7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBP1Q9NZI7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBP1Q9NZI7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBP1Q9NZI7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBP1Q9NZI7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBP1Q9NZI7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
UBP1Q9NZI7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBP1Q9NZI7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBP1Q9NZI7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
UBP1Q9NZI7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBP1Q9NZI7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
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