Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DLL3Q9NYJ7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DLL3Q9NYJ7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DLL3Q9NYJ7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DLL3Q9NYJ7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DLL3Q9NYJ7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DLL3Q9NYJ7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DLL3Q9NYJ7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DLL3Q9NYJ7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DLL3Q9NYJ7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DLL3Q9NYJ7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DLL3Q9NYJ7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DLL3Q9NYJ7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DLL3Q9NYJ7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DLL3Q9NYJ7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DLL3Q9NYJ7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DLL3Q9NYJ7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DLL3Q9NYJ7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DLL3Q9NYJ7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DLL3Q9NYJ7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DLL3Q9NYJ7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DLL3Q9NYJ7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DLL3Q9NYJ7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DLL3Q9NYJ7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DLL3Q9NYJ7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DLL3Q9NYJ7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DLL3Q9NYJ7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DLL3Q9NYJ7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DLL3Q9NYJ7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DLL3Q9NYJ7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DLL3Q9NYJ7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DLL3Q9NYJ7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DLL3Q9NYJ7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DLL3Q9NYJ7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DLL3Q9NYJ7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DLL3Q9NYJ7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DLL3Q9NYJ7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DLL3Q9NYJ7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DLL3Q9NYJ7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DLL3Q9NYJ7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DLL3Q9NYJ7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DLL3Q9NYJ7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DLL3Q9NYJ7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DLL3Q9NYJ7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DLL3Q9NYJ7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DLL3Q9NYJ7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DLL3Q9NYJ7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DLL3Q9NYJ7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DLL3Q9NYJ7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DLL3Q9NYJ7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DLL3Q9NYJ7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
DLL3Q9NYJ7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DLL3Q9NYJ7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DLL3Q9NYJ7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DLL3Q9NYJ7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DLL3Q9NYJ7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DLL3Q9NYJ7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DLL3Q9NYJ7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DLL3Q9NYJ7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DLL3Q9NYJ7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
DLL3Q9NYJ7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DLL3Q9NYJ7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DLL3Q9NYJ7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DLL3Q9NYJ7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DLL3Q9NYJ7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DLL3Q9NYJ7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DLL3Q9NYJ7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DLL3Q9NYJ7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DLL3Q9NYJ7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DLL3Q9NYJ7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DLL3Q9NYJ7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DLL3Q9NYJ7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DLL3Q9NYJ7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DLL3Q9NYJ7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DLL3Q9NYJ7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DLL3Q9NYJ7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DLL3Q9NYJ7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DLL3Q9NYJ7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
DLL3Q9NYJ7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DLL3Q9NYJ7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DLL3Q9NYJ7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DLL3Q9NYJ7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DLL3Q9NYJ7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DLL3Q9NYJ7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DLL3Q9NYJ7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DLL3Q9NYJ7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DLL3Q9NYJ7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DLL3Q9NYJ7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DLL3Q9NYJ7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DLL3Q9NYJ7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DLL3Q9NYJ7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DLL3Q9NYJ7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DLL3Q9NYJ7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DLL3Q9NYJ7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DLL3Q9NYJ7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DLL3Q9NYJ7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DLL3Q9NYJ7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DLL3Q9NYJ7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
DLL3Q9NYJ7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DLL3Q9NYJ7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms