Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY93

DDX56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX56Q9NY93 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX56Q9NY93 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX56Q9NY93 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX56Q9NY93 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX56Q9NY93 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX56Q9NY93 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX56Q9NY93 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX56Q9NY93 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX56Q9NY93 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX56Q9NY93 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX56Q9NY93 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX56Q9NY93 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX56Q9NY93 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX56Q9NY93 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX56Q9NY93 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX56Q9NY93 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX56Q9NY93 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX56Q9NY93 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX56Q9NY93 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX56Q9NY93 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX56Q9NY93 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX56Q9NY93 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX56Q9NY93 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX56Q9NY93 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX56Q9NY93 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX56Q9NY93 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX56Q9NY93 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX56Q9NY93 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX56Q9NY93 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX56Q9NY93 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX56Q9NY93 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX56Q9NY93 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX56Q9NY93 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX56Q9NY93 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX56Q9NY93 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX56Q9NY93 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX56Q9NY93 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX56Q9NY93 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX56Q9NY93 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX56Q9NY93 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX56Q9NY93 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX56Q9NY93 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX56Q9NY93 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX56Q9NY93 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX56Q9NY93 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX56Q9NY93 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX56Q9NY93 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX56Q9NY93 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX56Q9NY93 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX56Q9NY93 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX56Q9NY93 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX56Q9NY93 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX56Q9NY93 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX56Q9NY93 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX56Q9NY93 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX56Q9NY93 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX56Q9NY93 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX56Q9NY93 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX56Q9NY93 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX56Q9NY93 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX56Q9NY93 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX56Q9NY93 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX56Q9NY93 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX56Q9NY93 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX56Q9NY93 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX56Q9NY93 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX56Q9NY93 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DDX56Q9NY93 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DDX56Q9NY93 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX56Q9NY93 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX56Q9NY93 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX56Q9NY93 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX56Q9NY93 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX56Q9NY93 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX56Q9NY93 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX56Q9NY93 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX56Q9NY93 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX56Q9NY93 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX56Q9NY93 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX56Q9NY93 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX56Q9NY93 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX56Q9NY93 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX56Q9NY93 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX56Q9NY93 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX56Q9NY93 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX56Q9NY93 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX56Q9NY93 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX56Q9NY93 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX56Q9NY93 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX56Q9NY93 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX56Q9NY93 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX56Q9NY93 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX56Q9NY93 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX56Q9NY93 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX56Q9NY93 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX56Q9NY93 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX56Q9NY93 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX56Q9NY93 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX56Q9NY93 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX56Q9NY93 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms