Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GIN1Q9NXP7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GIN1Q9NXP7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GIN1Q9NXP7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GIN1Q9NXP7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GIN1Q9NXP7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GIN1Q9NXP7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GIN1Q9NXP7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GIN1Q9NXP7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GIN1Q9NXP7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GIN1Q9NXP7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GIN1Q9NXP7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GIN1Q9NXP7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GIN1Q9NXP7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GIN1Q9NXP7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GIN1Q9NXP7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GIN1Q9NXP7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GIN1Q9NXP7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GIN1Q9NXP7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GIN1Q9NXP7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GIN1Q9NXP7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GIN1Q9NXP7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GIN1Q9NXP7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GIN1Q9NXP7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GIN1Q9NXP7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GIN1Q9NXP7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GIN1Q9NXP7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GIN1Q9NXP7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GIN1Q9NXP7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GIN1Q9NXP7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GIN1Q9NXP7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GIN1Q9NXP7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GIN1Q9NXP7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GIN1Q9NXP7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GIN1Q9NXP7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GIN1Q9NXP7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GIN1Q9NXP7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GIN1Q9NXP7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GIN1Q9NXP7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GIN1Q9NXP7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GIN1Q9NXP7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GIN1Q9NXP7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GIN1Q9NXP7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GIN1Q9NXP7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GIN1Q9NXP7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GIN1Q9NXP7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GIN1Q9NXP7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GIN1Q9NXP7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GIN1Q9NXP7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GIN1Q9NXP7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GIN1Q9NXP7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GIN1Q9NXP7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GIN1Q9NXP7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GIN1Q9NXP7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GIN1Q9NXP7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GIN1Q9NXP7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GIN1Q9NXP7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GIN1Q9NXP7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GIN1Q9NXP7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GIN1Q9NXP7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GIN1Q9NXP7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GIN1Q9NXP7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GIN1Q9NXP7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GIN1Q9NXP7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GIN1Q9NXP7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GIN1Q9NXP7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GIN1Q9NXP7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GIN1Q9NXP7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GIN1Q9NXP7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GIN1Q9NXP7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GIN1Q9NXP7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GIN1Q9NXP7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GIN1Q9NXP7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GIN1Q9NXP7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GIN1Q9NXP7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GIN1Q9NXP7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GIN1Q9NXP7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GIN1Q9NXP7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GIN1Q9NXP7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GIN1Q9NXP7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GIN1Q9NXP7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GIN1Q9NXP7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GIN1Q9NXP7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GIN1Q9NXP7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GIN1Q9NXP7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GIN1Q9NXP7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GIN1Q9NXP7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GIN1Q9NXP7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GIN1Q9NXP7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GIN1Q9NXP7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GIN1Q9NXP7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GIN1Q9NXP7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GIN1Q9NXP7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GIN1Q9NXP7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GIN1Q9NXP7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GIN1Q9NXP7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GIN1Q9NXP7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GIN1Q9NXP7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GIN1Q9NXP7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GIN1Q9NXP7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms