Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf109Q9NX04 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf109Q9NX04 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf109Q9NX04 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf109Q9NX04 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf109Q9NX04 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf109Q9NX04 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf109Q9NX04 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf109Q9NX04 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf109Q9NX04 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf109Q9NX04 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf109Q9NX04 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf109Q9NX04 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf109Q9NX04 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf109Q9NX04 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf109Q9NX04 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf109Q9NX04 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C1orf109Q9NX04 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C1orf109Q9NX04 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
C1orf109Q9NX04 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf109Q9NX04 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf109Q9NX04 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf109Q9NX04 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf109Q9NX04 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf109Q9NX04 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf109Q9NX04 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1orf109Q9NX04 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1orf109Q9NX04 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
C1orf109Q9NX04 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf109Q9NX04 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf109Q9NX04 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1orf109Q9NX04 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C1orf109Q9NX04 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C1orf109Q9NX04 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C1orf109Q9NX04 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1orf109Q9NX04 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1orf109Q9NX04 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1orf109Q9NX04 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1orf109Q9NX04 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1orf109Q9NX04 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1orf109Q9NX04 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1orf109Q9NX04 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
C1orf109Q9NX04 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1orf109Q9NX04 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
C1orf109Q9NX04 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C1orf109Q9NX04 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1orf109Q9NX04 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1orf109Q9NX04 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
C1orf109Q9NX04 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1orf109Q9NX04 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1orf109Q9NX04 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
C1orf109Q9NX04 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1orf109Q9NX04 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C1orf109Q9NX04 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1orf109Q9NX04 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1orf109Q9NX04 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1orf109Q9NX04 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C1orf109Q9NX04 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C1orf109Q9NX04 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C1orf109Q9NX04 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C1orf109Q9NX04 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C1orf109Q9NX04 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1orf109Q9NX04 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1orf109Q9NX04 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1orf109Q9NX04 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C1orf109Q9NX04 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1orf109Q9NX04 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1orf109Q9NX04 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1orf109Q9NX04 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C1orf109Q9NX04 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1orf109Q9NX04 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C1orf109Q9NX04 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1orf109Q9NX04 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C1orf109Q9NX04 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf109Q9NX04 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf109Q9NX04 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C1orf109Q9NX04 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1orf109Q9NX04 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1orf109Q9NX04 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
C1orf109Q9NX04 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C1orf109Q9NX04 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf109Q9NX04 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C1orf109Q9NX04 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1orf109Q9NX04 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1orf109Q9NX04 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C1orf109Q9NX04 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1orf109Q9NX04 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1orf109Q9NX04 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C1orf109Q9NX04 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1orf109Q9NX04 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1orf109Q9NX04 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1orf109Q9NX04 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1orf109Q9NX04 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1orf109Q9NX04 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
C1orf109Q9NX04 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1orf109Q9NX04 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1orf109Q9NX04 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1orf109Q9NX04 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1orf109Q9NX04 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf109Q9NX04 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms