Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW08

POLR3B, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3BQ9NW08 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR3BQ9NW08 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR3BQ9NW08 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR3BQ9NW08 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR3BQ9NW08 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR3BQ9NW08 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR3BQ9NW08 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR3BQ9NW08 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3BQ9NW08 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3BQ9NW08 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3BQ9NW08 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3BQ9NW08 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR3BQ9NW08 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR3BQ9NW08 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR3BQ9NW08 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR3BQ9NW08 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR3BQ9NW08 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR3BQ9NW08 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR3BQ9NW08 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR3BQ9NW08 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR3BQ9NW08 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR3BQ9NW08 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR3BQ9NW08 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR3BQ9NW08 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR3BQ9NW08 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR3BQ9NW08 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR3BQ9NW08 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR3BQ9NW08 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR3BQ9NW08 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR3BQ9NW08 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR3BQ9NW08 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR3BQ9NW08 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
POLR3BQ9NW08 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR3BQ9NW08 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR3BQ9NW08 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR3BQ9NW08 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR3BQ9NW08 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR3BQ9NW08 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR3BQ9NW08 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR3BQ9NW08 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR3BQ9NW08 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3BQ9NW08 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR3BQ9NW08 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
POLR3BQ9NW08 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR3BQ9NW08 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR3BQ9NW08 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR3BQ9NW08 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
POLR3BQ9NW08 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR3BQ9NW08 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR3BQ9NW08 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR3BQ9NW08 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR3BQ9NW08 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR3BQ9NW08 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR3BQ9NW08 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR3BQ9NW08 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR3BQ9NW08 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR3BQ9NW08 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR3BQ9NW08 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR3BQ9NW08 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR3BQ9NW08 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR3BQ9NW08 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR3BQ9NW08 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR3BQ9NW08 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR3BQ9NW08 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR3BQ9NW08 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR3BQ9NW08 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR3BQ9NW08 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR3BQ9NW08 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR3BQ9NW08 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR3BQ9NW08 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3BQ9NW08 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3BQ9NW08 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3BQ9NW08 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3BQ9NW08 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3BQ9NW08 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3BQ9NW08 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3BQ9NW08 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR3BQ9NW08 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR3BQ9NW08 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR3BQ9NW08 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR3BQ9NW08 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR3BQ9NW08 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR3BQ9NW08 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR3BQ9NW08 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR3BQ9NW08 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR3BQ9NW08 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR3BQ9NW08 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR3BQ9NW08 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR3BQ9NW08 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR3BQ9NW08 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR3BQ9NW08 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR3BQ9NW08 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR3BQ9NW08 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR3BQ9NW08 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR3BQ9NW08 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR3BQ9NW08 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR3BQ9NW08 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR3BQ9NW08 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR3BQ9NW08 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR3BQ9NW08 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms