Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG0

CHRAC1, Chromatin accessibility complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRAC1Q9NRG0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRAC1Q9NRG0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRAC1Q9NRG0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRAC1Q9NRG0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRAC1Q9NRG0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRAC1Q9NRG0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHRAC1Q9NRG0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRAC1Q9NRG0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRAC1Q9NRG0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHRAC1Q9NRG0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRAC1Q9NRG0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRAC1Q9NRG0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRAC1Q9NRG0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRAC1Q9NRG0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRAC1Q9NRG0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHRAC1Q9NRG0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRAC1Q9NRG0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRAC1Q9NRG0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRAC1Q9NRG0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRAC1Q9NRG0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRAC1Q9NRG0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRAC1Q9NRG0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRAC1Q9NRG0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRAC1Q9NRG0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRAC1Q9NRG0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHRAC1Q9NRG0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHRAC1Q9NRG0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRAC1Q9NRG0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRAC1Q9NRG0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRAC1Q9NRG0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHRAC1Q9NRG0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRAC1Q9NRG0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRAC1Q9NRG0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRAC1Q9NRG0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRAC1Q9NRG0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRAC1Q9NRG0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRAC1Q9NRG0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRAC1Q9NRG0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRAC1Q9NRG0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHRAC1Q9NRG0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRAC1Q9NRG0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRAC1Q9NRG0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRAC1Q9NRG0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRAC1Q9NRG0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRAC1Q9NRG0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRAC1Q9NRG0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHRAC1Q9NRG0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRAC1Q9NRG0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRAC1Q9NRG0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRAC1Q9NRG0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRAC1Q9NRG0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHRAC1Q9NRG0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHRAC1Q9NRG0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHRAC1Q9NRG0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHRAC1Q9NRG0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHRAC1Q9NRG0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CHRAC1Q9NRG0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHRAC1Q9NRG0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHRAC1Q9NRG0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHRAC1Q9NRG0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHRAC1Q9NRG0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHRAC1Q9NRG0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHRAC1Q9NRG0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHRAC1Q9NRG0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHRAC1Q9NRG0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHRAC1Q9NRG0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHRAC1Q9NRG0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHRAC1Q9NRG0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHRAC1Q9NRG0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHRAC1Q9NRG0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRAC1Q9NRG0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHRAC1Q9NRG0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRAC1Q9NRG0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRAC1Q9NRG0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRAC1Q9NRG0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRAC1Q9NRG0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRAC1Q9NRG0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRAC1Q9NRG0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRAC1Q9NRG0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRAC1Q9NRG0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRAC1Q9NRG0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRAC1Q9NRG0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRAC1Q9NRG0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRAC1Q9NRG0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHRAC1Q9NRG0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRAC1Q9NRG0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRAC1Q9NRG0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRAC1Q9NRG0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRAC1Q9NRG0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRAC1Q9NRG0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRAC1Q9NRG0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRAC1Q9NRG0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRAC1Q9NRG0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHRAC1Q9NRG0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHRAC1Q9NRG0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHRAC1Q9NRG0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CHRAC1Q9NRG0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHRAC1Q9NRG0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CHRAC1Q9NRG0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRAC1Q9NRG0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms