Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC6

SPTBN5, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN5Q9NRC6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPTBN5Q9NRC6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPTBN5Q9NRC6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPTBN5Q9NRC6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPTBN5Q9NRC6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPTBN5Q9NRC6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPTBN5Q9NRC6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPTBN5Q9NRC6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPTBN5Q9NRC6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SPTBN5Q9NRC6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPTBN5Q9NRC6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SPTBN5Q9NRC6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SPTBN5Q9NRC6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SPTBN5Q9NRC6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SPTBN5Q9NRC6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPTBN5Q9NRC6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPTBN5Q9NRC6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPTBN5Q9NRC6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPTBN5Q9NRC6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPTBN5Q9NRC6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPTBN5Q9NRC6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SPTBN5Q9NRC6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SPTBN5Q9NRC6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPTBN5Q9NRC6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SPTBN5Q9NRC6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPTBN5Q9NRC6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SPTBN5Q9NRC6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPTBN5Q9NRC6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPTBN5Q9NRC6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPTBN5Q9NRC6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SPTBN5Q9NRC6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPTBN5Q9NRC6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPTBN5Q9NRC6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SPTBN5Q9NRC6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SPTBN5Q9NRC6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SPTBN5Q9NRC6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SPTBN5Q9NRC6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SPTBN5Q9NRC6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SPTBN5Q9NRC6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPTBN5Q9NRC6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPTBN5Q9NRC6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPTBN5Q9NRC6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPTBN5Q9NRC6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SPTBN5Q9NRC6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPTBN5Q9NRC6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPTBN5Q9NRC6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPTBN5Q9NRC6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPTBN5Q9NRC6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SPTBN5Q9NRC6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPTBN5Q9NRC6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPTBN5Q9NRC6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPTBN5Q9NRC6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SPTBN5Q9NRC6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPTBN5Q9NRC6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPTBN5Q9NRC6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SPTBN5Q9NRC6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SPTBN5Q9NRC6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPTBN5Q9NRC6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPTBN5Q9NRC6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPTBN5Q9NRC6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPTBN5Q9NRC6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPTBN5Q9NRC6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPTBN5Q9NRC6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPTBN5Q9NRC6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPTBN5Q9NRC6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPTBN5Q9NRC6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPTBN5Q9NRC6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPTBN5Q9NRC6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPTBN5Q9NRC6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPTBN5Q9NRC6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPTBN5Q9NRC6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPTBN5Q9NRC6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPTBN5Q9NRC6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPTBN5Q9NRC6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPTBN5Q9NRC6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SPTBN5Q9NRC6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SPTBN5Q9NRC6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPTBN5Q9NRC6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SPTBN5Q9NRC6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPTBN5Q9NRC6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SPTBN5Q9NRC6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPTBN5Q9NRC6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPTBN5Q9NRC6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPTBN5Q9NRC6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPTBN5Q9NRC6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPTBN5Q9NRC6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPTBN5Q9NRC6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPTBN5Q9NRC6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SPTBN5Q9NRC6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPTBN5Q9NRC6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SPTBN5Q9NRC6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPTBN5Q9NRC6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPTBN5Q9NRC6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SPTBN5Q9NRC6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPTBN5Q9NRC6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPTBN5Q9NRC6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPTBN5Q9NRC6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPTBN5Q9NRC6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPTBN5Q9NRC6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SPTBN5Q9NRC6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms