Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NECTIN3Q9NQS3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NECTIN3Q9NQS3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NECTIN3Q9NQS3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NECTIN3Q9NQS3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NECTIN3Q9NQS3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NECTIN3Q9NQS3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NECTIN3Q9NQS3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NECTIN3Q9NQS3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECTIN3Q9NQS3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NECTIN3Q9NQS3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NECTIN3Q9NQS3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NECTIN3Q9NQS3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NECTIN3Q9NQS3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NECTIN3Q9NQS3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECTIN3Q9NQS3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NECTIN3Q9NQS3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NECTIN3Q9NQS3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NECTIN3Q9NQS3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NECTIN3Q9NQS3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NECTIN3Q9NQS3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NECTIN3Q9NQS3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NECTIN3Q9NQS3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NECTIN3Q9NQS3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NECTIN3Q9NQS3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NECTIN3Q9NQS3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NECTIN3Q9NQS3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NECTIN3Q9NQS3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NECTIN3Q9NQS3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NECTIN3Q9NQS3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NECTIN3Q9NQS3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NECTIN3Q9NQS3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NECTIN3Q9NQS3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NECTIN3Q9NQS3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NECTIN3Q9NQS3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NECTIN3Q9NQS3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NECTIN3Q9NQS3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NECTIN3Q9NQS3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NECTIN3Q9NQS3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NECTIN3Q9NQS3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NECTIN3Q9NQS3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NECTIN3Q9NQS3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NECTIN3Q9NQS3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NECTIN3Q9NQS3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NECTIN3Q9NQS3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NECTIN3Q9NQS3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NECTIN3Q9NQS3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NECTIN3Q9NQS3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NECTIN3Q9NQS3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NECTIN3Q9NQS3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NECTIN3Q9NQS3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NECTIN3Q9NQS3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NECTIN3Q9NQS3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NECTIN3Q9NQS3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NECTIN3Q9NQS3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NECTIN3Q9NQS3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NECTIN3Q9NQS3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NECTIN3Q9NQS3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NECTIN3Q9NQS3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NECTIN3Q9NQS3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NECTIN3Q9NQS3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NECTIN3Q9NQS3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NECTIN3Q9NQS3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NECTIN3Q9NQS3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NECTIN3Q9NQS3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NECTIN3Q9NQS3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECTIN3Q9NQS3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECTIN3Q9NQS3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECTIN3Q9NQS3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECTIN3Q9NQS3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECTIN3Q9NQS3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NECTIN3Q9NQS3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NECTIN3Q9NQS3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NECTIN3Q9NQS3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NECTIN3Q9NQS3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NECTIN3Q9NQS3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NECTIN3Q9NQS3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NECTIN3Q9NQS3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NECTIN3Q9NQS3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NECTIN3Q9NQS3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NECTIN3Q9NQS3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NECTIN3Q9NQS3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NECTIN3Q9NQS3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NECTIN3Q9NQS3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NECTIN3Q9NQS3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NECTIN3Q9NQS3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NECTIN3Q9NQS3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NECTIN3Q9NQS3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NECTIN3Q9NQS3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NECTIN3Q9NQS3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NECTIN3Q9NQS3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NECTIN3Q9NQS3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NECTIN3Q9NQS3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NECTIN3Q9NQS3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NECTIN3Q9NQS3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NECTIN3Q9NQS3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NECTIN3Q9NQS3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NECTIN3Q9NQS3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NECTIN3Q9NQS3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NECTIN3Q9NQS3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms