Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ89

C12orf4, Protein C12orf4, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf4Q9NQ89 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C12orf4Q9NQ89 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C12orf4Q9NQ89 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C12orf4Q9NQ89 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C12orf4Q9NQ89 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C12orf4Q9NQ89 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C12orf4Q9NQ89 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C12orf4Q9NQ89 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C12orf4Q9NQ89 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C12orf4Q9NQ89 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C12orf4Q9NQ89 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C12orf4Q9NQ89 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C12orf4Q9NQ89 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C12orf4Q9NQ89 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C12orf4Q9NQ89 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C12orf4Q9NQ89 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C12orf4Q9NQ89 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C12orf4Q9NQ89 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C12orf4Q9NQ89 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C12orf4Q9NQ89 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C12orf4Q9NQ89 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C12orf4Q9NQ89 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C12orf4Q9NQ89 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C12orf4Q9NQ89 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C12orf4Q9NQ89 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C12orf4Q9NQ89 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C12orf4Q9NQ89 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C12orf4Q9NQ89 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C12orf4Q9NQ89 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C12orf4Q9NQ89 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C12orf4Q9NQ89 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C12orf4Q9NQ89 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C12orf4Q9NQ89 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C12orf4Q9NQ89 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C12orf4Q9NQ89 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C12orf4Q9NQ89 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C12orf4Q9NQ89 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C12orf4Q9NQ89 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C12orf4Q9NQ89 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C12orf4Q9NQ89 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf4Q9NQ89 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf4Q9NQ89 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C12orf4Q9NQ89 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C12orf4Q9NQ89 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C12orf4Q9NQ89 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C12orf4Q9NQ89 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C12orf4Q9NQ89 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C12orf4Q9NQ89 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C12orf4Q9NQ89 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C12orf4Q9NQ89 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C12orf4Q9NQ89 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C12orf4Q9NQ89 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C12orf4Q9NQ89 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C12orf4Q9NQ89 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C12orf4Q9NQ89 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C12orf4Q9NQ89 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C12orf4Q9NQ89 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C12orf4Q9NQ89 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C12orf4Q9NQ89 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C12orf4Q9NQ89 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C12orf4Q9NQ89 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C12orf4Q9NQ89 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C12orf4Q9NQ89 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C12orf4Q9NQ89 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C12orf4Q9NQ89 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C12orf4Q9NQ89 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C12orf4Q9NQ89 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C12orf4Q9NQ89 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C12orf4Q9NQ89 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C12orf4Q9NQ89 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C12orf4Q9NQ89 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C12orf4Q9NQ89 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C12orf4Q9NQ89 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C12orf4Q9NQ89 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C12orf4Q9NQ89 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C12orf4Q9NQ89 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C12orf4Q9NQ89 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C12orf4Q9NQ89 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C12orf4Q9NQ89 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C12orf4Q9NQ89 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C12orf4Q9NQ89 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C12orf4Q9NQ89 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C12orf4Q9NQ89 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C12orf4Q9NQ89 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C12orf4Q9NQ89 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C12orf4Q9NQ89 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C12orf4Q9NQ89 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C12orf4Q9NQ89 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C12orf4Q9NQ89 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C12orf4Q9NQ89 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C12orf4Q9NQ89 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C12orf4Q9NQ89 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C12orf4Q9NQ89 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C12orf4Q9NQ89 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C12orf4Q9NQ89 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C12orf4Q9NQ89 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C12orf4Q9NQ89 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C12orf4Q9NQ89 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C12orf4Q9NQ89 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C12orf4Q9NQ89 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms