Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB18Q9NP72 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB18Q9NP72 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB18Q9NP72 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB18Q9NP72 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB18Q9NP72 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB18Q9NP72 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB18Q9NP72 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB18Q9NP72 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB18Q9NP72 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB18Q9NP72 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB18Q9NP72 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB18Q9NP72 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB18Q9NP72 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB18Q9NP72 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB18Q9NP72 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB18Q9NP72 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB18Q9NP72 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB18Q9NP72 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB18Q9NP72 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB18Q9NP72 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB18Q9NP72 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB18Q9NP72 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB18Q9NP72 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB18Q9NP72 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB18Q9NP72 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB18Q9NP72 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB18Q9NP72 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB18Q9NP72 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB18Q9NP72 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB18Q9NP72 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB18Q9NP72 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB18Q9NP72 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB18Q9NP72 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB18Q9NP72 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB18Q9NP72 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB18Q9NP72 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB18Q9NP72 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB18Q9NP72 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB18Q9NP72 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB18Q9NP72 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB18Q9NP72 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB18Q9NP72 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB18Q9NP72 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB18Q9NP72 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB18Q9NP72 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB18Q9NP72 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB18Q9NP72 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB18Q9NP72 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB18Q9NP72 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB18Q9NP72 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB18Q9NP72 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB18Q9NP72 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB18Q9NP72 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB18Q9NP72 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB18Q9NP72 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB18Q9NP72 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB18Q9NP72 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB18Q9NP72 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB18Q9NP72 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB18Q9NP72 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB18Q9NP72 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB18Q9NP72 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB18Q9NP72 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB18Q9NP72 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB18Q9NP72 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB18Q9NP72 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB18Q9NP72 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB18Q9NP72 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB18Q9NP72 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB18Q9NP72 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB18Q9NP72 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB18Q9NP72 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB18Q9NP72 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB18Q9NP72 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB18Q9NP72 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB18Q9NP72 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB18Q9NP72 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB18Q9NP72 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB18Q9NP72 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB18Q9NP72 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB18Q9NP72 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB18Q9NP72 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB18Q9NP72 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB18Q9NP72 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB18Q9NP72 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB18Q9NP72 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB18Q9NP72 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB18Q9NP72 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB18Q9NP72 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB18Q9NP72 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB18Q9NP72 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB18Q9NP72 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB18Q9NP72 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB18Q9NP72 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB18Q9NP72 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB18Q9NP72 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB18Q9NP72 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB18Q9NP72 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB18Q9NP72 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms