Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ3

DNAJC4, DnaJ homolog subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4Q9NNZ3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJC4Q9NNZ3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJC4Q9NNZ3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJC4Q9NNZ3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DNAJC4Q9NNZ3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJC4Q9NNZ3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJC4Q9NNZ3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DNAJC4Q9NNZ3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJC4Q9NNZ3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJC4Q9NNZ3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DNAJC4Q9NNZ3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJC4Q9NNZ3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJC4Q9NNZ3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJC4Q9NNZ3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DNAJC4Q9NNZ3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJC4Q9NNZ3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DNAJC4Q9NNZ3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJC4Q9NNZ3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJC4Q9NNZ3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJC4Q9NNZ3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJC4Q9NNZ3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DNAJC4Q9NNZ3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJC4Q9NNZ3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DNAJC4Q9NNZ3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DNAJC4Q9NNZ3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DNAJC4Q9NNZ3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DNAJC4Q9NNZ3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DNAJC4Q9NNZ3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DNAJC4Q9NNZ3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DNAJC4Q9NNZ3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DNAJC4Q9NNZ3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DNAJC4Q9NNZ3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DNAJC4Q9NNZ3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DNAJC4Q9NNZ3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DNAJC4Q9NNZ3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNAJC4Q9NNZ3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNAJC4Q9NNZ3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNAJC4Q9NNZ3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNAJC4Q9NNZ3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNAJC4Q9NNZ3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNAJC4Q9NNZ3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNAJC4Q9NNZ3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNAJC4Q9NNZ3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNAJC4Q9NNZ3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNAJC4Q9NNZ3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNAJC4Q9NNZ3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNAJC4Q9NNZ3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DNAJC4Q9NNZ3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNAJC4Q9NNZ3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNAJC4Q9NNZ3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNAJC4Q9NNZ3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNAJC4Q9NNZ3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNAJC4Q9NNZ3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNAJC4Q9NNZ3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DNAJC4Q9NNZ3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DNAJC4Q9NNZ3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNAJC4Q9NNZ3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNAJC4Q9NNZ3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNAJC4Q9NNZ3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNAJC4Q9NNZ3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNAJC4Q9NNZ3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DNAJC4Q9NNZ3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DNAJC4Q9NNZ3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DNAJC4Q9NNZ3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC4Q9NNZ3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC4Q9NNZ3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC4Q9NNZ3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DNAJC4Q9NNZ3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC4Q9NNZ3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DNAJC4Q9NNZ3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DNAJC4Q9NNZ3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC4Q9NNZ3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC4Q9NNZ3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC4Q9NNZ3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DNAJC4Q9NNZ3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
DNAJC4Q9NNZ3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DNAJC4Q9NNZ3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DNAJC4Q9NNZ3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DNAJC4Q9NNZ3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DNAJC4Q9NNZ3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DNAJC4Q9NNZ3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DNAJC4Q9NNZ3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DNAJC4Q9NNZ3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DNAJC4Q9NNZ3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DNAJC4Q9NNZ3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DNAJC4Q9NNZ3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DNAJC4Q9NNZ3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DNAJC4Q9NNZ3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DNAJC4Q9NNZ3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DNAJC4Q9NNZ3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DNAJC4Q9NNZ3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DNAJC4Q9NNZ3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DNAJC4Q9NNZ3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC4Q9NNZ3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC4Q9NNZ3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC4Q9NNZ3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DNAJC4Q9NNZ3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms