Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIN28AQ9H9Z2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIN28AQ9H9Z2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIN28AQ9H9Z2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIN28AQ9H9Z2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIN28AQ9H9Z2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIN28AQ9H9Z2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIN28AQ9H9Z2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIN28AQ9H9Z2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIN28AQ9H9Z2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIN28AQ9H9Z2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIN28AQ9H9Z2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIN28AQ9H9Z2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIN28AQ9H9Z2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIN28AQ9H9Z2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LIN28AQ9H9Z2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LIN28AQ9H9Z2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LIN28AQ9H9Z2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIN28AQ9H9Z2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIN28AQ9H9Z2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LIN28AQ9H9Z2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LIN28AQ9H9Z2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIN28AQ9H9Z2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIN28AQ9H9Z2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIN28AQ9H9Z2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIN28AQ9H9Z2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIN28AQ9H9Z2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIN28AQ9H9Z2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIN28AQ9H9Z2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIN28AQ9H9Z2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIN28AQ9H9Z2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIN28AQ9H9Z2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIN28AQ9H9Z2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIN28AQ9H9Z2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIN28AQ9H9Z2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIN28AQ9H9Z2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LIN28AQ9H9Z2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIN28AQ9H9Z2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIN28AQ9H9Z2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIN28AQ9H9Z2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIN28AQ9H9Z2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LIN28AQ9H9Z2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIN28AQ9H9Z2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LIN28AQ9H9Z2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIN28AQ9H9Z2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LIN28AQ9H9Z2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LIN28AQ9H9Z2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LIN28AQ9H9Z2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LIN28AQ9H9Z2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIN28AQ9H9Z2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LIN28AQ9H9Z2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LIN28AQ9H9Z2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LIN28AQ9H9Z2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LIN28AQ9H9Z2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LIN28AQ9H9Z2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIN28AQ9H9Z2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIN28AQ9H9Z2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIN28AQ9H9Z2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LIN28AQ9H9Z2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LIN28AQ9H9Z2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LIN28AQ9H9Z2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LIN28AQ9H9Z2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LIN28AQ9H9Z2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIN28AQ9H9Z2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LIN28AQ9H9Z2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LIN28AQ9H9Z2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIN28AQ9H9Z2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIN28AQ9H9Z2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIN28AQ9H9Z2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIN28AQ9H9Z2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LIN28AQ9H9Z2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIN28AQ9H9Z2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIN28AQ9H9Z2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIN28AQ9H9Z2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIN28AQ9H9Z2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIN28AQ9H9Z2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIN28AQ9H9Z2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIN28AQ9H9Z2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIN28AQ9H9Z2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIN28AQ9H9Z2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIN28AQ9H9Z2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIN28AQ9H9Z2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIN28AQ9H9Z2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIN28AQ9H9Z2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIN28AQ9H9Z2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LIN28AQ9H9Z2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIN28AQ9H9Z2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIN28AQ9H9Z2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIN28AQ9H9Z2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIN28AQ9H9Z2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIN28AQ9H9Z2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIN28AQ9H9Z2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIN28AQ9H9Z2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIN28AQ9H9Z2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIN28AQ9H9Z2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIN28AQ9H9Z2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIN28AQ9H9Z2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIN28AQ9H9Z2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIN28AQ9H9Z2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIN28AQ9H9Z2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms