Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6L5

RETREG1, Reticulophagy regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG1Q9H6L5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RETREG1Q9H6L5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RETREG1Q9H6L5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RETREG1Q9H6L5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RETREG1Q9H6L5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RETREG1Q9H6L5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RETREG1Q9H6L5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RETREG1Q9H6L5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RETREG1Q9H6L5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RETREG1Q9H6L5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RETREG1Q9H6L5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RETREG1Q9H6L5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RETREG1Q9H6L5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RETREG1Q9H6L5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RETREG1Q9H6L5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RETREG1Q9H6L5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RETREG1Q9H6L5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RETREG1Q9H6L5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RETREG1Q9H6L5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RETREG1Q9H6L5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RETREG1Q9H6L5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RETREG1Q9H6L5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RETREG1Q9H6L5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RETREG1Q9H6L5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RETREG1Q9H6L5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RETREG1Q9H6L5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RETREG1Q9H6L5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RETREG1Q9H6L5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RETREG1Q9H6L5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RETREG1Q9H6L5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RETREG1Q9H6L5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RETREG1Q9H6L5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RETREG1Q9H6L5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RETREG1Q9H6L5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RETREG1Q9H6L5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RETREG1Q9H6L5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RETREG1Q9H6L5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RETREG1Q9H6L5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RETREG1Q9H6L5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RETREG1Q9H6L5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RETREG1Q9H6L5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RETREG1Q9H6L5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RETREG1Q9H6L5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RETREG1Q9H6L5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RETREG1Q9H6L5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RETREG1Q9H6L5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RETREG1Q9H6L5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RETREG1Q9H6L5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RETREG1Q9H6L5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RETREG1Q9H6L5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RETREG1Q9H6L5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RETREG1Q9H6L5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RETREG1Q9H6L5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RETREG1Q9H6L5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RETREG1Q9H6L5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RETREG1Q9H6L5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RETREG1Q9H6L5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RETREG1Q9H6L5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RETREG1Q9H6L5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RETREG1Q9H6L5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RETREG1Q9H6L5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RETREG1Q9H6L5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RETREG1Q9H6L5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RETREG1Q9H6L5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RETREG1Q9H6L5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RETREG1Q9H6L5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RETREG1Q9H6L5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RETREG1Q9H6L5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RETREG1Q9H6L5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RETREG1Q9H6L5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RETREG1Q9H6L5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RETREG1Q9H6L5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RETREG1Q9H6L5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RETREG1Q9H6L5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RETREG1Q9H6L5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RETREG1Q9H6L5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RETREG1Q9H6L5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RETREG1Q9H6L5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RETREG1Q9H6L5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RETREG1Q9H6L5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
RETREG1Q9H6L5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RETREG1Q9H6L5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RETREG1Q9H6L5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RETREG1Q9H6L5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RETREG1Q9H6L5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RETREG1Q9H6L5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RETREG1Q9H6L5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RETREG1Q9H6L5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RETREG1Q9H6L5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RETREG1Q9H6L5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RETREG1Q9H6L5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RETREG1Q9H6L5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RETREG1Q9H6L5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RETREG1Q9H6L5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RETREG1Q9H6L5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RETREG1Q9H6L5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RETREG1Q9H6L5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RETREG1Q9H6L5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RETREG1Q9H6L5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RETREG1Q9H6L5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms