Protein–RNA interactions for Protein: Q9H611

PIF1, ATP-dependent DNA helicase PIF1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIF1Q9H611 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIF1Q9H611 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIF1Q9H611 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIF1Q9H611 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIF1Q9H611 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIF1Q9H611 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIF1Q9H611 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIF1Q9H611 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PIF1Q9H611 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIF1Q9H611 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIF1Q9H611 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIF1Q9H611 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIF1Q9H611 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIF1Q9H611 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIF1Q9H611 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIF1Q9H611 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIF1Q9H611 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIF1Q9H611 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIF1Q9H611 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIF1Q9H611 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIF1Q9H611 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIF1Q9H611 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIF1Q9H611 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PIF1Q9H611 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PIF1Q9H611 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PIF1Q9H611 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIF1Q9H611 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIF1Q9H611 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIF1Q9H611 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIF1Q9H611 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIF1Q9H611 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PIF1Q9H611 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIF1Q9H611 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIF1Q9H611 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIF1Q9H611 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIF1Q9H611 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIF1Q9H611 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PIF1Q9H611 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIF1Q9H611 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIF1Q9H611 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIF1Q9H611 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIF1Q9H611 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIF1Q9H611 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIF1Q9H611 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIF1Q9H611 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIF1Q9H611 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIF1Q9H611 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIF1Q9H611 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIF1Q9H611 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIF1Q9H611 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIF1Q9H611 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIF1Q9H611 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIF1Q9H611 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIF1Q9H611 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIF1Q9H611 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIF1Q9H611 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIF1Q9H611 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIF1Q9H611 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIF1Q9H611 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIF1Q9H611 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIF1Q9H611 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIF1Q9H611 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIF1Q9H611 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIF1Q9H611 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIF1Q9H611 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIF1Q9H611 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIF1Q9H611 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIF1Q9H611 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIF1Q9H611 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIF1Q9H611 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIF1Q9H611 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIF1Q9H611 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIF1Q9H611 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PIF1Q9H611 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIF1Q9H611 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIF1Q9H611 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIF1Q9H611 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIF1Q9H611 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIF1Q9H611 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIF1Q9H611 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PIF1Q9H611 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIF1Q9H611 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIF1Q9H611 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIF1Q9H611 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIF1Q9H611 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIF1Q9H611 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIF1Q9H611 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIF1Q9H611 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIF1Q9H611 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIF1Q9H611 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIF1Q9H611 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIF1Q9H611 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIF1Q9H611 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PIF1Q9H611 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIF1Q9H611 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIF1Q9H611 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIF1Q9H611 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIF1Q9H611 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIF1Q9H611 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIF1Q9H611 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms