Protein–RNA interactions for Protein: Q9H511

KLHL31, Kelch-like protein 31, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL31Q9H511 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL31Q9H511 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL31Q9H511 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL31Q9H511 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL31Q9H511 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL31Q9H511 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KLHL31Q9H511 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL31Q9H511 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL31Q9H511 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL31Q9H511 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL31Q9H511 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL31Q9H511 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL31Q9H511 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL31Q9H511 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL31Q9H511 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL31Q9H511 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL31Q9H511 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL31Q9H511 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL31Q9H511 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL31Q9H511 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL31Q9H511 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL31Q9H511 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL31Q9H511 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL31Q9H511 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL31Q9H511 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL31Q9H511 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL31Q9H511 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL31Q9H511 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL31Q9H511 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL31Q9H511 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL31Q9H511 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL31Q9H511 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL31Q9H511 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL31Q9H511 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL31Q9H511 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL31Q9H511 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL31Q9H511 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL31Q9H511 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL31Q9H511 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL31Q9H511 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL31Q9H511 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL31Q9H511 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL31Q9H511 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL31Q9H511 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL31Q9H511 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL31Q9H511 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL31Q9H511 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL31Q9H511 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL31Q9H511 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL31Q9H511 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL31Q9H511 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL31Q9H511 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL31Q9H511 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL31Q9H511 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL31Q9H511 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL31Q9H511 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL31Q9H511 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL31Q9H511 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL31Q9H511 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL31Q9H511 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL31Q9H511 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL31Q9H511 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL31Q9H511 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KLHL31Q9H511 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL31Q9H511 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL31Q9H511 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL31Q9H511 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL31Q9H511 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL31Q9H511 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL31Q9H511 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL31Q9H511 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL31Q9H511 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL31Q9H511 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL31Q9H511 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL31Q9H511 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL31Q9H511 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL31Q9H511 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL31Q9H511 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL31Q9H511 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL31Q9H511 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL31Q9H511 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL31Q9H511 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL31Q9H511 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL31Q9H511 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL31Q9H511 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL31Q9H511 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL31Q9H511 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL31Q9H511 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL31Q9H511 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL31Q9H511 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL31Q9H511 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL31Q9H511 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL31Q9H511 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL31Q9H511 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL31Q9H511 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL31Q9H511 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL31Q9H511 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL31Q9H511 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL31Q9H511 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL31Q9H511 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms