Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR6

RTN4R, Reticulon-4 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4RQ9BZR6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN4RQ9BZR6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RTN4RQ9BZR6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RTN4RQ9BZR6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RTN4RQ9BZR6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN4RQ9BZR6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN4RQ9BZR6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RTN4RQ9BZR6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN4RQ9BZR6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN4RQ9BZR6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN4RQ9BZR6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN4RQ9BZR6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN4RQ9BZR6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RTN4RQ9BZR6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN4RQ9BZR6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN4RQ9BZR6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RTN4RQ9BZR6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN4RQ9BZR6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN4RQ9BZR6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RTN4RQ9BZR6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN4RQ9BZR6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN4RQ9BZR6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN4RQ9BZR6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN4RQ9BZR6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RTN4RQ9BZR6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RTN4RQ9BZR6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RTN4RQ9BZR6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN4RQ9BZR6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN4RQ9BZR6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RTN4RQ9BZR6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN4RQ9BZR6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN4RQ9BZR6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN4RQ9BZR6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RTN4RQ9BZR6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN4RQ9BZR6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN4RQ9BZR6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RTN4RQ9BZR6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN4RQ9BZR6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN4RQ9BZR6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RTN4RQ9BZR6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN4RQ9BZR6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN4RQ9BZR6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RTN4RQ9BZR6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN4RQ9BZR6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN4RQ9BZR6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RTN4RQ9BZR6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN4RQ9BZR6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN4RQ9BZR6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RTN4RQ9BZR6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTN4RQ9BZR6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RTN4RQ9BZR6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RTN4RQ9BZR6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN4RQ9BZR6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN4RQ9BZR6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RTN4RQ9BZR6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN4RQ9BZR6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN4RQ9BZR6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN4RQ9BZR6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN4RQ9BZR6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN4RQ9BZR6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RTN4RQ9BZR6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN4RQ9BZR6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN4RQ9BZR6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN4RQ9BZR6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN4RQ9BZR6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN4RQ9BZR6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RTN4RQ9BZR6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN4RQ9BZR6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN4RQ9BZR6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN4RQ9BZR6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN4RQ9BZR6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN4RQ9BZR6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RTN4RQ9BZR6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RTN4RQ9BZR6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RTN4RQ9BZR6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RTN4RQ9BZR6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN4RQ9BZR6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN4RQ9BZR6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN4RQ9BZR6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN4RQ9BZR6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN4RQ9BZR6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN4RQ9BZR6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RTN4RQ9BZR6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN4RQ9BZR6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN4RQ9BZR6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN4RQ9BZR6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RTN4RQ9BZR6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN4RQ9BZR6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RTN4RQ9BZR6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RTN4RQ9BZR6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTN4RQ9BZR6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RTN4RQ9BZR6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RTN4RQ9BZR6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTN4RQ9BZR6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTN4RQ9BZR6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTN4RQ9BZR6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTN4RQ9BZR6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN4RQ9BZR6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTN4RQ9BZR6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTN4RQ9BZR6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms