Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS4

TMEM59, Transmembrane protein 59, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM59Q9BXS4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM59Q9BXS4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM59Q9BXS4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM59Q9BXS4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM59Q9BXS4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM59Q9BXS4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM59Q9BXS4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM59Q9BXS4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM59Q9BXS4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM59Q9BXS4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM59Q9BXS4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM59Q9BXS4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM59Q9BXS4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM59Q9BXS4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM59Q9BXS4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM59Q9BXS4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM59Q9BXS4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM59Q9BXS4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM59Q9BXS4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM59Q9BXS4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM59Q9BXS4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM59Q9BXS4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM59Q9BXS4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM59Q9BXS4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM59Q9BXS4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM59Q9BXS4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM59Q9BXS4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM59Q9BXS4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM59Q9BXS4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM59Q9BXS4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM59Q9BXS4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM59Q9BXS4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM59Q9BXS4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM59Q9BXS4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM59Q9BXS4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM59Q9BXS4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM59Q9BXS4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM59Q9BXS4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM59Q9BXS4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM59Q9BXS4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM59Q9BXS4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM59Q9BXS4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM59Q9BXS4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM59Q9BXS4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM59Q9BXS4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM59Q9BXS4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM59Q9BXS4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM59Q9BXS4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM59Q9BXS4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM59Q9BXS4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM59Q9BXS4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM59Q9BXS4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM59Q9BXS4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM59Q9BXS4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM59Q9BXS4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM59Q9BXS4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM59Q9BXS4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM59Q9BXS4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM59Q9BXS4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM59Q9BXS4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM59Q9BXS4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM59Q9BXS4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM59Q9BXS4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM59Q9BXS4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM59Q9BXS4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM59Q9BXS4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM59Q9BXS4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM59Q9BXS4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM59Q9BXS4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM59Q9BXS4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM59Q9BXS4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM59Q9BXS4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM59Q9BXS4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM59Q9BXS4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM59Q9BXS4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM59Q9BXS4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM59Q9BXS4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM59Q9BXS4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM59Q9BXS4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM59Q9BXS4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM59Q9BXS4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM59Q9BXS4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM59Q9BXS4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM59Q9BXS4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM59Q9BXS4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM59Q9BXS4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM59Q9BXS4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM59Q9BXS4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM59Q9BXS4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM59Q9BXS4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM59Q9BXS4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM59Q9BXS4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM59Q9BXS4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM59Q9BXS4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM59Q9BXS4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM59Q9BXS4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM59Q9BXS4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM59Q9BXS4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM59Q9BXS4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM59Q9BXS4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms